Protein–RNA interactions for Protein: P51878

CASP5, Caspase-5, humanhuman

Predictions only

Length 434 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP5P51878 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CASP5P51878 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CASP5P51878 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CASP5P51878 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CASP5P51878 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CASP5P51878 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CASP5P51878 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CASP5P51878 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CASP5P51878 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CASP5P51878 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CASP5P51878 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CASP5P51878 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CASP5P51878 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CASP5P51878 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CASP5P51878 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CASP5P51878 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CASP5P51878 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CASP5P51878 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CASP5P51878 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CASP5P51878 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CASP5P51878 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CASP5P51878 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CASP5P51878 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CASP5P51878 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CASP5P51878 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CASP5P51878 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CASP5P51878 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CASP5P51878 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CASP5P51878 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CASP5P51878 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CASP5P51878 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CASP5P51878 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CASP5P51878 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CASP5P51878 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CASP5P51878 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CASP5P51878 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CASP5P51878 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CASP5P51878 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CASP5P51878 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CASP5P51878 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CASP5P51878 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CASP5P51878 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CASP5P51878 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CASP5P51878 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CASP5P51878 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CASP5P51878 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CASP5P51878 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CASP5P51878 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CASP5P51878 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CASP5P51878 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CASP5P51878 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CASP5P51878 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CASP5P51878 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CASP5P51878 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CASP5P51878 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CASP5P51878 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CASP5P51878 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CASP5P51878 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CASP5P51878 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CASP5P51878 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CASP5P51878 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CASP5P51878 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CASP5P51878 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CASP5P51878 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CASP5P51878 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CASP5P51878 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CASP5P51878 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CASP5P51878 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CASP5P51878 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CASP5P51878 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CASP5P51878 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CASP5P51878 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CASP5P51878 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CASP5P51878 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CASP5P51878 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CASP5P51878 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CASP5P51878 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CASP5P51878 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CASP5P51878 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CASP5P51878 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CASP5P51878 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CASP5P51878 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CASP5P51878 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CASP5P51878 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CASP5P51878 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CASP5P51878 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CASP5P51878 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CASP5P51878 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CASP5P51878 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CASP5P51878 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CASP5P51878 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CASP5P51878 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CASP5P51878 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CASP5P51878 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CASP5P51878 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CASP5P51878 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CASP5P51878 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CASP5P51878 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CASP5P51878 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CASP5P51878 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.6 ms