Protein–RNA interactions for Protein: P51148

RAB5C, Ras-related protein Rab-5C, humanhuman

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB5CP51148 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
RAB5CP51148 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RAB5CP51148 COLGALT1-201ENST00000252599 3704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RAB5CP51148 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RAB5CP51148 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
RAB5CP51148 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RAB5CP51148 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RAB5CP51148 EHMT2-201ENST00000375528 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RAB5CP51148 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RAB5CP51148 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RAB5CP51148 PPP4R3B-205ENST00000616288 4310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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RAB5CP51148 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RAB5CP51148 PCDHB3-201ENST00000231130 3355 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RAB5CP51148 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RAB5CP51148 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
RAB5CP51148 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RAB5CP51148 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RAB5CP51148 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RAB5CP51148 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RAB5CP51148 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RAB5CP51148 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RAB5CP51148 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RAB5CP51148 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RAB5CP51148 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RAB5CP51148 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RAB5CP51148 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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RAB5CP51148 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
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RAB5CP51148 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RAB5CP51148 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RAB5CP51148 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
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RAB5CP51148 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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RAB5CP51148 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RAB5CP51148 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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RAB5CP51148 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RAB5CP51148 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RAB5CP51148 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RAB5CP51148 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RAB5CP51148 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
RAB5CP51148 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
RAB5CP51148 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
RAB5CP51148 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
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