Protein–RNA interactions for Protein: P50238

CRIP1, Cysteine-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP1P50238 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
CRIP1P50238 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
CRIP1P50238 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CRIP1P50238 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CRIP1P50238 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CRIP1P50238 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
CRIP1P50238 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CRIP1P50238 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CRIP1P50238 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CRIP1P50238 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CRIP1P50238 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CRIP1P50238 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CRIP1P50238 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
CRIP1P50238 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
CRIP1P50238 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
CRIP1P50238 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
CRIP1P50238 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
CRIP1P50238 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CRIP1P50238 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CRIP1P50238 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
CRIP1P50238 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
CRIP1P50238 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
CRIP1P50238 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CRIP1P50238 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
CRIP1P50238 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CRIP1P50238 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CRIP1P50238 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
CRIP1P50238 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
CRIP1P50238 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CRIP1P50238 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
CRIP1P50238 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
CRIP1P50238 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
CRIP1P50238 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
CRIP1P50238 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
CRIP1P50238 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CRIP1P50238 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
CRIP1P50238 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms