Protein–RNA interactions for Protein: P50213

IDH3A, Isocitrate dehydrogenase [NAD] subunit alpha, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IDH3AP50213 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IDH3AP50213 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IDH3AP50213 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IDH3AP50213 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IDH3AP50213 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IDH3AP50213 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IDH3AP50213 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IDH3AP50213 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
IDH3AP50213 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IDH3AP50213 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
IDH3AP50213 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IDH3AP50213 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IDH3AP50213 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IDH3AP50213 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IDH3AP50213 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IDH3AP50213 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IDH3AP50213 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IDH3AP50213 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IDH3AP50213 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IDH3AP50213 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IDH3AP50213 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IDH3AP50213 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IDH3AP50213 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IDH3AP50213 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IDH3AP50213 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IDH3AP50213 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IDH3AP50213 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IDH3AP50213 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IDH3AP50213 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IDH3AP50213 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IDH3AP50213 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IDH3AP50213 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IDH3AP50213 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IDH3AP50213 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
IDH3AP50213 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
IDH3AP50213 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IDH3AP50213 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IDH3AP50213 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
IDH3AP50213 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IDH3AP50213 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IDH3AP50213 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IDH3AP50213 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IDH3AP50213 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IDH3AP50213 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IDH3AP50213 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IDH3AP50213 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IDH3AP50213 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IDH3AP50213 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IDH3AP50213 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IDH3AP50213 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IDH3AP50213 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IDH3AP50213 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IDH3AP50213 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IDH3AP50213 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IDH3AP50213 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IDH3AP50213 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IDH3AP50213 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IDH3AP50213 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IDH3AP50213 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IDH3AP50213 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IDH3AP50213 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IDH3AP50213 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
IDH3AP50213 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IDH3AP50213 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IDH3AP50213 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IDH3AP50213 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
IDH3AP50213 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
IDH3AP50213 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IDH3AP50213 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IDH3AP50213 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IDH3AP50213 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IDH3AP50213 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IDH3AP50213 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IDH3AP50213 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IDH3AP50213 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IDH3AP50213 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IDH3AP50213 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IDH3AP50213 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IDH3AP50213 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IDH3AP50213 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IDH3AP50213 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IDH3AP50213 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IDH3AP50213 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IDH3AP50213 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IDH3AP50213 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IDH3AP50213 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IDH3AP50213 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IDH3AP50213 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
IDH3AP50213 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IDH3AP50213 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IDH3AP50213 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IDH3AP50213 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IDH3AP50213 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IDH3AP50213 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IDH3AP50213 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IDH3AP50213 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IDH3AP50213 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
IDH3AP50213 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IDH3AP50213 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IDH3AP50213 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms