Protein–RNA interactions for Protein: P46060

RANGAP1, Ran GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RANGAP1P46060 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RANGAP1P46060 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RANGAP1P46060 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RANGAP1P46060 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RANGAP1P46060 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RANGAP1P46060 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RANGAP1P46060 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RANGAP1P46060 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RANGAP1P46060 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RANGAP1P46060 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
RANGAP1P46060 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RANGAP1P46060 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RANGAP1P46060 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RANGAP1P46060 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RANGAP1P46060 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RANGAP1P46060 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RANGAP1P46060 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RANGAP1P46060 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RANGAP1P46060 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RANGAP1P46060 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RANGAP1P46060 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RANGAP1P46060 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RANGAP1P46060 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RANGAP1P46060 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RANGAP1P46060 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RANGAP1P46060 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RANGAP1P46060 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RANGAP1P46060 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RANGAP1P46060 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RANGAP1P46060 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RANGAP1P46060 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RANGAP1P46060 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RANGAP1P46060 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RANGAP1P46060 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
RANGAP1P46060 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RANGAP1P46060 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RANGAP1P46060 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RANGAP1P46060 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RANGAP1P46060 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RANGAP1P46060 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RANGAP1P46060 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RANGAP1P46060 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RANGAP1P46060 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RANGAP1P46060 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RANGAP1P46060 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RANGAP1P46060 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RANGAP1P46060 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RANGAP1P46060 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RANGAP1P46060 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
RANGAP1P46060 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RANGAP1P46060 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RANGAP1P46060 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RANGAP1P46060 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RANGAP1P46060 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RANGAP1P46060 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RANGAP1P46060 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RANGAP1P46060 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RANGAP1P46060 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RANGAP1P46060 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RANGAP1P46060 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RANGAP1P46060 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RANGAP1P46060 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RANGAP1P46060 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
RANGAP1P46060 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RANGAP1P46060 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RANGAP1P46060 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RANGAP1P46060 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
RANGAP1P46060 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
RANGAP1P46060 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RANGAP1P46060 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RANGAP1P46060 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RANGAP1P46060 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RANGAP1P46060 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RANGAP1P46060 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RANGAP1P46060 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RANGAP1P46060 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RANGAP1P46060 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RANGAP1P46060 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RANGAP1P46060 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RANGAP1P46060 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RANGAP1P46060 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RANGAP1P46060 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RANGAP1P46060 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RANGAP1P46060 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RANGAP1P46060 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RANGAP1P46060 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RANGAP1P46060 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RANGAP1P46060 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RANGAP1P46060 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RANGAP1P46060 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RANGAP1P46060 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RANGAP1P46060 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RANGAP1P46060 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RANGAP1P46060 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RANGAP1P46060 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
RANGAP1P46060 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RANGAP1P46060 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RANGAP1P46060 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RANGAP1P46060 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RANGAP1P46060 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.8 ms