Protein–RNA interactions for Protein: P37268

FDFT1, Squalene synthase, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDFT1P37268 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FDFT1P37268 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FDFT1P37268 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FDFT1P37268 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
FDFT1P37268 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FDFT1P37268 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FDFT1P37268 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FDFT1P37268 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FDFT1P37268 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FDFT1P37268 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FDFT1P37268 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FDFT1P37268 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FDFT1P37268 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FDFT1P37268 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FDFT1P37268 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FDFT1P37268 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FDFT1P37268 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FDFT1P37268 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FDFT1P37268 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FDFT1P37268 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FDFT1P37268 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FDFT1P37268 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FDFT1P37268 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FDFT1P37268 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FDFT1P37268 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FDFT1P37268 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FDFT1P37268 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FDFT1P37268 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FDFT1P37268 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FDFT1P37268 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FDFT1P37268 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FDFT1P37268 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FDFT1P37268 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FDFT1P37268 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FDFT1P37268 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FDFT1P37268 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FDFT1P37268 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FDFT1P37268 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FDFT1P37268 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FDFT1P37268 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FDFT1P37268 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FDFT1P37268 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FDFT1P37268 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FDFT1P37268 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FDFT1P37268 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FDFT1P37268 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FDFT1P37268 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FDFT1P37268 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FDFT1P37268 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FDFT1P37268 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FDFT1P37268 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FDFT1P37268 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FDFT1P37268 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FDFT1P37268 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FDFT1P37268 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FDFT1P37268 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FDFT1P37268 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FDFT1P37268 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FDFT1P37268 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FDFT1P37268 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FDFT1P37268 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FDFT1P37268 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FDFT1P37268 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FDFT1P37268 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FDFT1P37268 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FDFT1P37268 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FDFT1P37268 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FDFT1P37268 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
FDFT1P37268 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FDFT1P37268 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FDFT1P37268 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FDFT1P37268 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FDFT1P37268 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FDFT1P37268 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FDFT1P37268 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FDFT1P37268 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FDFT1P37268 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
FDFT1P37268 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FDFT1P37268 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FDFT1P37268 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FDFT1P37268 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FDFT1P37268 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FDFT1P37268 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
FDFT1P37268 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FDFT1P37268 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FDFT1P37268 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
FDFT1P37268 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FDFT1P37268 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FDFT1P37268 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FDFT1P37268 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FDFT1P37268 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
FDFT1P37268 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FDFT1P37268 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FDFT1P37268 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FDFT1P37268 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FDFT1P37268 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FDFT1P37268 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FDFT1P37268 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FDFT1P37268 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FDFT1P37268 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms