Protein–RNA interactions for Protein: P35609

ACTN2, Alpha-actinin-2, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN2P35609 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ACTN2P35609 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ACTN2P35609 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ACTN2P35609 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ACTN2P35609 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ACTN2P35609 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ACTN2P35609 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ACTN2P35609 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ACTN2P35609 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ACTN2P35609 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ACTN2P35609 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ACTN2P35609 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ACTN2P35609 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ACTN2P35609 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ACTN2P35609 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ACTN2P35609 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ACTN2P35609 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ACTN2P35609 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ACTN2P35609 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ACTN2P35609 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ACTN2P35609 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ACTN2P35609 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACTN2P35609 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACTN2P35609 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACTN2P35609 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACTN2P35609 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACTN2P35609 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACTN2P35609 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACTN2P35609 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACTN2P35609 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACTN2P35609 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACTN2P35609 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACTN2P35609 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACTN2P35609 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACTN2P35609 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACTN2P35609 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACTN2P35609 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACTN2P35609 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACTN2P35609 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACTN2P35609 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACTN2P35609 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACTN2P35609 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ACTN2P35609 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ACTN2P35609 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACTN2P35609 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ACTN2P35609 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACTN2P35609 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACTN2P35609 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACTN2P35609 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACTN2P35609 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACTN2P35609 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACTN2P35609 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACTN2P35609 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACTN2P35609 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACTN2P35609 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACTN2P35609 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACTN2P35609 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACTN2P35609 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACTN2P35609 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACTN2P35609 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACTN2P35609 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACTN2P35609 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACTN2P35609 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACTN2P35609 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACTN2P35609 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACTN2P35609 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACTN2P35609 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACTN2P35609 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACTN2P35609 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ACTN2P35609 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ACTN2P35609 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ACTN2P35609 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ACTN2P35609 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ACTN2P35609 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ACTN2P35609 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ACTN2P35609 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
ACTN2P35609 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ACTN2P35609 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ACTN2P35609 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ACTN2P35609 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ACTN2P35609 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ACTN2P35609 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ACTN2P35609 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ACTN2P35609 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ACTN2P35609 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ACTN2P35609 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ACTN2P35609 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ACTN2P35609 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ACTN2P35609 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ACTN2P35609 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ACTN2P35609 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ACTN2P35609 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ACTN2P35609 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ACTN2P35609 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ACTN2P35609 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ACTN2P35609 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ACTN2P35609 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ACTN2P35609 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ACTN2P35609 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ACTN2P35609 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 717.7 ms