Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXD13P35453 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXD13P35453 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXD13P35453 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXD13P35453 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXD13P35453 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXD13P35453 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXD13P35453 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXD13P35453 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXD13P35453 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXD13P35453 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXD13P35453 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXD13P35453 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXD13P35453 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXD13P35453 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXD13P35453 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXD13P35453 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXD13P35453 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXD13P35453 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXD13P35453 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXD13P35453 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXD13P35453 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HOXD13P35453 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HOXD13P35453 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HOXD13P35453 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HOXD13P35453 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HOXD13P35453 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HOXD13P35453 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HOXD13P35453 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HOXD13P35453 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HOXD13P35453 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HOXD13P35453 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HOXD13P35453 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HOXD13P35453 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HOXD13P35453 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HOXD13P35453 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HOXD13P35453 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HOXD13P35453 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HOXD13P35453 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HOXD13P35453 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HOXD13P35453 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HOXD13P35453 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HOXD13P35453 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HOXD13P35453 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HOXD13P35453 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HOXD13P35453 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HOXD13P35453 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HOXD13P35453 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
HOXD13P35453 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
HOXD13P35453 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
HOXD13P35453 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
HOXD13P35453 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
HOXD13P35453 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
HOXD13P35453 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
HOXD13P35453 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
HOXD13P35453 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
HOXD13P35453 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
HOXD13P35453 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
HOXD13P35453 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
HOXD13P35453 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
HOXD13P35453 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXD13P35453 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXD13P35453 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXD13P35453 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXD13P35453 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXD13P35453 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXD13P35453 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXD13P35453 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXD13P35453 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXD13P35453 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXD13P35453 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXD13P35453 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXD13P35453 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXD13P35453 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXD13P35453 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXD13P35453 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXD13P35453 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXD13P35453 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXD13P35453 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXD13P35453 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXD13P35453 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXD13P35453 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXD13P35453 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXD13P35453 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXD13P35453 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXD13P35453 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXD13P35453 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXD13P35453 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXD13P35453 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXD13P35453 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXD13P35453 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXD13P35453 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXD13P35453 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXD13P35453 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXD13P35453 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXD13P35453 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXD13P35453 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXD13P35453 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXD13P35453 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXD13P35453 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms