Protein–RNA interactions for Protein: P28074

PSMB5, Proteasome subunit beta type-5, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB5P28074 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMB5P28074 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMB5P28074 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMB5P28074 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMB5P28074 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMB5P28074 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMB5P28074 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMB5P28074 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMB5P28074 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMB5P28074 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMB5P28074 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMB5P28074 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMB5P28074 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMB5P28074 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMB5P28074 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMB5P28074 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMB5P28074 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMB5P28074 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMB5P28074 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMB5P28074 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMB5P28074 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMB5P28074 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMB5P28074 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMB5P28074 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMB5P28074 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMB5P28074 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMB5P28074 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMB5P28074 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMB5P28074 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMB5P28074 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMB5P28074 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMB5P28074 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMB5P28074 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMB5P28074 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMB5P28074 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMB5P28074 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMB5P28074 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMB5P28074 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMB5P28074 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMB5P28074 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMB5P28074 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMB5P28074 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMB5P28074 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMB5P28074 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMB5P28074 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMB5P28074 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMB5P28074 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMB5P28074 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMB5P28074 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMB5P28074 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMB5P28074 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMB5P28074 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMB5P28074 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMB5P28074 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMB5P28074 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMB5P28074 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PSMB5P28074 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PSMB5P28074 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PSMB5P28074 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PSMB5P28074 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PSMB5P28074 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PSMB5P28074 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PSMB5P28074 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PSMB5P28074 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PSMB5P28074 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PSMB5P28074 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PSMB5P28074 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PSMB5P28074 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PSMB5P28074 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PSMB5P28074 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PSMB5P28074 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PSMB5P28074 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PSMB5P28074 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PSMB5P28074 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PSMB5P28074 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PSMB5P28074 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PSMB5P28074 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PSMB5P28074 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PSMB5P28074 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PSMB5P28074 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PSMB5P28074 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PSMB5P28074 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PSMB5P28074 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PSMB5P28074 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PSMB5P28074 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PSMB5P28074 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PSMB5P28074 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PSMB5P28074 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PSMB5P28074 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PSMB5P28074 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PSMB5P28074 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PSMB5P28074 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PSMB5P28074 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PSMB5P28074 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PSMB5P28074 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PSMB5P28074 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PSMB5P28074 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PSMB5P28074 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PSMB5P28074 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PSMB5P28074 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms