Protein–RNA interactions for Protein: P21953

BCKDHB, 2-oxoisovalerate dehydrogenase subunit beta, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCKDHBP21953 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BCKDHBP21953 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BCKDHBP21953 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BCKDHBP21953 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BCKDHBP21953 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BCKDHBP21953 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BCKDHBP21953 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BCKDHBP21953 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BCKDHBP21953 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BCKDHBP21953 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BCKDHBP21953 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BCKDHBP21953 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BCKDHBP21953 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BCKDHBP21953 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BCKDHBP21953 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BCKDHBP21953 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BCKDHBP21953 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BCKDHBP21953 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BCKDHBP21953 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BCKDHBP21953 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BCKDHBP21953 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BCKDHBP21953 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BCKDHBP21953 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BCKDHBP21953 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BCKDHBP21953 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BCKDHBP21953 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BCKDHBP21953 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BCKDHBP21953 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BCKDHBP21953 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BCKDHBP21953 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BCKDHBP21953 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
BCKDHBP21953 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BCKDHBP21953 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BCKDHBP21953 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BCKDHBP21953 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
BCKDHBP21953 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BCKDHBP21953 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
BCKDHBP21953 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BCKDHBP21953 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BCKDHBP21953 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BCKDHBP21953 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
BCKDHBP21953 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BCKDHBP21953 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BCKDHBP21953 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BCKDHBP21953 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BCKDHBP21953 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BCKDHBP21953 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BCKDHBP21953 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BCKDHBP21953 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BCKDHBP21953 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BCKDHBP21953 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BCKDHBP21953 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
BCKDHBP21953 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BCKDHBP21953 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
BCKDHBP21953 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
BCKDHBP21953 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
BCKDHBP21953 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
BCKDHBP21953 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
BCKDHBP21953 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BCKDHBP21953 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BCKDHBP21953 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BCKDHBP21953 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BCKDHBP21953 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BCKDHBP21953 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BCKDHBP21953 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BCKDHBP21953 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BCKDHBP21953 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
BCKDHBP21953 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
BCKDHBP21953 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BCKDHBP21953 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BCKDHBP21953 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
BCKDHBP21953 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BCKDHBP21953 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BCKDHBP21953 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BCKDHBP21953 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BCKDHBP21953 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BCKDHBP21953 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
BCKDHBP21953 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
BCKDHBP21953 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BCKDHBP21953 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BCKDHBP21953 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BCKDHBP21953 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BCKDHBP21953 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BCKDHBP21953 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BCKDHBP21953 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BCKDHBP21953 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BCKDHBP21953 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BCKDHBP21953 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BCKDHBP21953 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BCKDHBP21953 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BCKDHBP21953 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BCKDHBP21953 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BCKDHBP21953 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BCKDHBP21953 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BCKDHBP21953 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BCKDHBP21953 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BCKDHBP21953 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BCKDHBP21953 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BCKDHBP21953 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BCKDHBP21953 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71 ms