Protein–RNA interactions for Protein: P20132

SDS, L-serine dehydratase/L-threonine deaminase, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDSP20132 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SDSP20132 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SDSP20132 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SDSP20132 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SDSP20132 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SDSP20132 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SDSP20132 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SDSP20132 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SDSP20132 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
SDSP20132 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SDSP20132 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SDSP20132 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SDSP20132 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SDSP20132 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SDSP20132 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SDSP20132 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SDSP20132 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SDSP20132 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SDSP20132 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SDSP20132 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SDSP20132 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SDSP20132 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SDSP20132 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SDSP20132 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SDSP20132 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SDSP20132 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SDSP20132 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SDSP20132 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SDSP20132 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SDSP20132 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SDSP20132 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SDSP20132 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SDSP20132 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SDSP20132 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SDSP20132 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SDSP20132 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SDSP20132 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SDSP20132 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SDSP20132 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SDSP20132 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SDSP20132 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SDSP20132 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SDSP20132 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SDSP20132 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SDSP20132 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SDSP20132 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SDSP20132 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SDSP20132 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SDSP20132 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SDSP20132 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SDSP20132 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SDSP20132 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SDSP20132 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SDSP20132 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SDSP20132 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
SDSP20132 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SDSP20132 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SDSP20132 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SDSP20132 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SDSP20132 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SDSP20132 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SDSP20132 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SDSP20132 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SDSP20132 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SDSP20132 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SDSP20132 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SDSP20132 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SDSP20132 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SDSP20132 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SDSP20132 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SDSP20132 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
SDSP20132 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SDSP20132 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SDSP20132 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SDSP20132 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SDSP20132 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SDSP20132 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SDSP20132 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SDSP20132 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SDSP20132 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SDSP20132 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SDSP20132 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SDSP20132 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SDSP20132 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SDSP20132 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SDSP20132 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SDSP20132 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SDSP20132 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SDSP20132 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SDSP20132 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SDSP20132 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SDSP20132 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SDSP20132 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SDSP20132 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SDSP20132 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SDSP20132 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SDSP20132 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SDSP20132 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SDSP20132 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SDSP20132 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms