Protein–RNA interactions for Protein: P18669

PGAM1, Phosphoglycerate mutase 1, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGAM1P18669 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PGAM1P18669 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PGAM1P18669 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PGAM1P18669 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PGAM1P18669 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PGAM1P18669 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PGAM1P18669 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PGAM1P18669 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PGAM1P18669 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PGAM1P18669 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PGAM1P18669 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PGAM1P18669 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PGAM1P18669 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PGAM1P18669 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PGAM1P18669 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PGAM1P18669 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PGAM1P18669 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PGAM1P18669 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PGAM1P18669 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PGAM1P18669 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PGAM1P18669 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PGAM1P18669 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PGAM1P18669 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PGAM1P18669 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PGAM1P18669 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PGAM1P18669 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PGAM1P18669 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PGAM1P18669 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PGAM1P18669 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PGAM1P18669 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PGAM1P18669 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PGAM1P18669 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PGAM1P18669 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PGAM1P18669 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PGAM1P18669 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PGAM1P18669 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PGAM1P18669 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PGAM1P18669 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PGAM1P18669 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PGAM1P18669 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PGAM1P18669 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PGAM1P18669 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PGAM1P18669 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PGAM1P18669 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PGAM1P18669 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PGAM1P18669 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PGAM1P18669 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PGAM1P18669 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PGAM1P18669 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PGAM1P18669 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PGAM1P18669 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PGAM1P18669 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PGAM1P18669 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PGAM1P18669 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PGAM1P18669 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PGAM1P18669 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PGAM1P18669 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PGAM1P18669 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PGAM1P18669 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PGAM1P18669 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PGAM1P18669 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PGAM1P18669 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PGAM1P18669 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PGAM1P18669 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PGAM1P18669 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PGAM1P18669 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PGAM1P18669 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PGAM1P18669 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PGAM1P18669 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PGAM1P18669 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PGAM1P18669 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
PGAM1P18669 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PGAM1P18669 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PGAM1P18669 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PGAM1P18669 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PGAM1P18669 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PGAM1P18669 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PGAM1P18669 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PGAM1P18669 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PGAM1P18669 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PGAM1P18669 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PGAM1P18669 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PGAM1P18669 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PGAM1P18669 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PGAM1P18669 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PGAM1P18669 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PGAM1P18669 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PGAM1P18669 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PGAM1P18669 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PGAM1P18669 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PGAM1P18669 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PGAM1P18669 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PGAM1P18669 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PGAM1P18669 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PGAM1P18669 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PGAM1P18669 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PGAM1P18669 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PGAM1P18669 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PGAM1P18669 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PGAM1P18669 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.1 ms