Protein–RNA interactions for Protein: P17987

TCP1, T-complex protein 1 subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCP1P17987 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TCP1P17987 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TCP1P17987 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TCP1P17987 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TCP1P17987 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TCP1P17987 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TCP1P17987 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TCP1P17987 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TCP1P17987 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TCP1P17987 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TCP1P17987 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TCP1P17987 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TCP1P17987 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TCP1P17987 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TCP1P17987 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TCP1P17987 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TCP1P17987 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TCP1P17987 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TCP1P17987 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TCP1P17987 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TCP1P17987 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TCP1P17987 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
TCP1P17987 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TCP1P17987 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TCP1P17987 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TCP1P17987 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TCP1P17987 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TCP1P17987 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TCP1P17987 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TCP1P17987 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TCP1P17987 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TCP1P17987 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TCP1P17987 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TCP1P17987 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TCP1P17987 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TCP1P17987 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TCP1P17987 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TCP1P17987 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TCP1P17987 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TCP1P17987 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TCP1P17987 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TCP1P17987 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TCP1P17987 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TCP1P17987 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TCP1P17987 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
TCP1P17987 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TCP1P17987 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TCP1P17987 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TCP1P17987 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TCP1P17987 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TCP1P17987 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
TCP1P17987 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TCP1P17987 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TCP1P17987 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TCP1P17987 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TCP1P17987 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TCP1P17987 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TCP1P17987 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TCP1P17987 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TCP1P17987 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TCP1P17987 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TCP1P17987 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TCP1P17987 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TCP1P17987 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TCP1P17987 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TCP1P17987 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TCP1P17987 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TCP1P17987 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TCP1P17987 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TCP1P17987 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TCP1P17987 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TCP1P17987 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TCP1P17987 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TCP1P17987 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TCP1P17987 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TCP1P17987 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TCP1P17987 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TCP1P17987 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TCP1P17987 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TCP1P17987 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TCP1P17987 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TCP1P17987 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TCP1P17987 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TCP1P17987 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TCP1P17987 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TCP1P17987 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TCP1P17987 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TCP1P17987 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TCP1P17987 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TCP1P17987 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TCP1P17987 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TCP1P17987 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TCP1P17987 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TCP1P17987 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TCP1P17987 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
TCP1P17987 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TCP1P17987 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TCP1P17987 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TCP1P17987 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TCP1P17987 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms