Protein–RNA interactions for Protein: P17812

CTPS1, CTP synthase 1, humanhuman

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Length 591 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1P17812 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTPS1P17812 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTPS1P17812 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTPS1P17812 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTPS1P17812 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTPS1P17812 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTPS1P17812 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTPS1P17812 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTPS1P17812 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTPS1P17812 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTPS1P17812 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CTPS1P17812 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTPS1P17812 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTPS1P17812 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CTPS1P17812 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTPS1P17812 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTPS1P17812 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTPS1P17812 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTPS1P17812 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTPS1P17812 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CTPS1P17812 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTPS1P17812 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTPS1P17812 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTPS1P17812 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTPS1P17812 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTPS1P17812 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTPS1P17812 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTPS1P17812 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTPS1P17812 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTPS1P17812 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTPS1P17812 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTPS1P17812 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTPS1P17812 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTPS1P17812 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTPS1P17812 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTPS1P17812 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTPS1P17812 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTPS1P17812 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTPS1P17812 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTPS1P17812 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTPS1P17812 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTPS1P17812 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTPS1P17812 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTPS1P17812 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTPS1P17812 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTPS1P17812 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTPS1P17812 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CTPS1P17812 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTPS1P17812 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTPS1P17812 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTPS1P17812 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTPS1P17812 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTPS1P17812 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTPS1P17812 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTPS1P17812 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTPS1P17812 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTPS1P17812 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CTPS1P17812 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTPS1P17812 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTPS1P17812 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTPS1P17812 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTPS1P17812 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTPS1P17812 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTPS1P17812 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTPS1P17812 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTPS1P17812 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTPS1P17812 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTPS1P17812 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTPS1P17812 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTPS1P17812 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTPS1P17812 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTPS1P17812 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTPS1P17812 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTPS1P17812 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTPS1P17812 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTPS1P17812 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTPS1P17812 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTPS1P17812 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTPS1P17812 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTPS1P17812 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTPS1P17812 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTPS1P17812 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTPS1P17812 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTPS1P17812 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTPS1P17812 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTPS1P17812 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTPS1P17812 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTPS1P17812 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTPS1P17812 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTPS1P17812 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTPS1P17812 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTPS1P17812 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTPS1P17812 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTPS1P17812 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTPS1P17812 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTPS1P17812 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTPS1P17812 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTPS1P17812 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTPS1P17812 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTPS1P17812 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
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