Protein–RNA interactions for Protein: P16333

NCK1, Cytoplasmic protein NCK1, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCK1P16333 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NCK1P16333 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NCK1P16333 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NCK1P16333 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NCK1P16333 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NCK1P16333 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NCK1P16333 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NCK1P16333 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NCK1P16333 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NCK1P16333 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NCK1P16333 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NCK1P16333 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NCK1P16333 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NCK1P16333 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NCK1P16333 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
NCK1P16333 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NCK1P16333 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NCK1P16333 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NCK1P16333 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NCK1P16333 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
NCK1P16333 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NCK1P16333 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NCK1P16333 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NCK1P16333 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NCK1P16333 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NCK1P16333 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NCK1P16333 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NCK1P16333 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NCK1P16333 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NCK1P16333 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NCK1P16333 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NCK1P16333 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NCK1P16333 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NCK1P16333 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NCK1P16333 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NCK1P16333 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NCK1P16333 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NCK1P16333 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NCK1P16333 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NCK1P16333 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NCK1P16333 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NCK1P16333 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NCK1P16333 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
NCK1P16333 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
NCK1P16333 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NCK1P16333 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NCK1P16333 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NCK1P16333 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NCK1P16333 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NCK1P16333 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NCK1P16333 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NCK1P16333 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NCK1P16333 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NCK1P16333 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NCK1P16333 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NCK1P16333 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NCK1P16333 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NCK1P16333 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NCK1P16333 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NCK1P16333 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NCK1P16333 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
NCK1P16333 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NCK1P16333 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
NCK1P16333 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NCK1P16333 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
NCK1P16333 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NCK1P16333 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
NCK1P16333 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NCK1P16333 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NCK1P16333 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
NCK1P16333 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
NCK1P16333 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NCK1P16333 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NCK1P16333 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NCK1P16333 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NCK1P16333 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NCK1P16333 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NCK1P16333 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NCK1P16333 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NCK1P16333 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NCK1P16333 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NCK1P16333 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NCK1P16333 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NCK1P16333 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NCK1P16333 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NCK1P16333 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NCK1P16333 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NCK1P16333 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NCK1P16333 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NCK1P16333 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NCK1P16333 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NCK1P16333 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NCK1P16333 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NCK1P16333 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NCK1P16333 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NCK1P16333 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NCK1P16333 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NCK1P16333 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NCK1P16333 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NCK1P16333 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms