Protein–RNA interactions for Protein: P13612

ITGA4, Integrin alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA4P13612 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ITGA4P13612 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ITGA4P13612 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ITGA4P13612 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ITGA4P13612 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ITGA4P13612 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ITGA4P13612 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ITGA4P13612 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ITGA4P13612 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ITGA4P13612 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ITGA4P13612 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ITGA4P13612 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ITGA4P13612 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ITGA4P13612 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ITGA4P13612 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ITGA4P13612 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ITGA4P13612 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ITGA4P13612 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ITGA4P13612 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
ITGA4P13612 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ITGA4P13612 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ITGA4P13612 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ITGA4P13612 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ITGA4P13612 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
ITGA4P13612 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ITGA4P13612 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ITGA4P13612 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ITGA4P13612 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
ITGA4P13612 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ITGA4P13612 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ITGA4P13612 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ITGA4P13612 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ITGA4P13612 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
ITGA4P13612 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ITGA4P13612 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ITGA4P13612 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ITGA4P13612 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ITGA4P13612 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ITGA4P13612 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ITGA4P13612 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ITGA4P13612 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ITGA4P13612 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ITGA4P13612 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ITGA4P13612 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ITGA4P13612 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ITGA4P13612 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ITGA4P13612 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ITGA4P13612 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ITGA4P13612 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ITGA4P13612 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ITGA4P13612 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ITGA4P13612 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ITGA4P13612 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ITGA4P13612 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ITGA4P13612 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ITGA4P13612 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ITGA4P13612 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ITGA4P13612 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ITGA4P13612 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ITGA4P13612 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ITGA4P13612 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ITGA4P13612 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ITGA4P13612 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ITGA4P13612 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ITGA4P13612 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ITGA4P13612 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ITGA4P13612 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ITGA4P13612 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ITGA4P13612 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ITGA4P13612 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ITGA4P13612 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ITGA4P13612 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ITGA4P13612 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ITGA4P13612 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ITGA4P13612 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ITGA4P13612 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ITGA4P13612 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ITGA4P13612 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ITGA4P13612 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ITGA4P13612 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ITGA4P13612 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ITGA4P13612 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ITGA4P13612 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ITGA4P13612 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ITGA4P13612 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ITGA4P13612 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ITGA4P13612 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ITGA4P13612 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ITGA4P13612 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ITGA4P13612 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ITGA4P13612 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ITGA4P13612 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ITGA4P13612 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ITGA4P13612 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ITGA4P13612 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGA4P13612 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGA4P13612 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGA4P13612 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGA4P13612 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGA4P13612 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms