Protein–RNA interactions for Protein: P07948

LYN, Tyrosine-protein kinase Lyn, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYNP07948 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LYNP07948 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LYNP07948 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LYNP07948 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LYNP07948 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LYNP07948 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LYNP07948 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LYNP07948 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LYNP07948 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LYNP07948 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
LYNP07948 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LYNP07948 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
LYNP07948 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
LYNP07948 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
LYNP07948 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LYNP07948 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LYNP07948 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LYNP07948 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LYNP07948 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LYNP07948 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LYNP07948 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LYNP07948 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LYNP07948 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LYNP07948 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LYNP07948 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LYNP07948 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
LYNP07948 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LYNP07948 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LYNP07948 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
LYNP07948 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LYNP07948 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LYNP07948 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC15.08■□□□□ 0
LYNP07948 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC15.08■□□□□ 0
LYNP07948 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LYNP07948 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LYNP07948 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
LYNP07948 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC15.08■□□□□ 0
LYNP07948 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
LYNP07948 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
LYNP07948 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LYNP07948 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
LYNP07948 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LYNP07948 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LYNP07948 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LYNP07948 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LYNP07948 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LYNP07948 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LYNP07948 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LYNP07948 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LYNP07948 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LYNP07948 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LYNP07948 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LYNP07948 TCAF1P1-201ENST00000414990 2232 ntBASIC15.08■□□□□ 0
LYNP07948 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LYNP07948 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LYNP07948 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LYNP07948 WLS-201ENST00000262348 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LYNP07948 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LYNP07948 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LYNP07948 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LYNP07948 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LYNP07948 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LYNP07948 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LYNP07948 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC15.07■□□□□ 0
LYNP07948 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LYNP07948 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LYNP07948 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LYNP07948 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LYNP07948 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LYNP07948 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LYNP07948 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LYNP07948 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LYNP07948 SLC23A1-201ENST00000348729 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LYNP07948 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LYNP07948 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LYNP07948 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LYNP07948 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LYNP07948 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LYNP07948 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LYNP07948 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC15.07■□□□□ 0
LYNP07948 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LYNP07948 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC15.07■□□□□ 0
LYNP07948 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LYNP07948 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC15.07■□□□□ 0
LYNP07948 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
LYNP07948 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC15.07■□□□□ 0
LYNP07948 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LYNP07948 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LYNP07948 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LYNP07948 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LYNP07948 PPP5D1-201ENST00000414155 1882 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LYNP07948 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LYNP07948 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LYNP07948 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LYNP07948 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LYNP07948 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LYNP07948 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LYNP07948 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LYNP07948 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LYNP07948 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms