Protein–RNA interactions for Protein: O94889

KLHL18, Kelch-like protein 18, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL18O94889 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL18O94889 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL18O94889 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL18O94889 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL18O94889 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL18O94889 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL18O94889 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL18O94889 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL18O94889 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL18O94889 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL18O94889 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL18O94889 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL18O94889 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL18O94889 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL18O94889 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL18O94889 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL18O94889 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL18O94889 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL18O94889 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL18O94889 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL18O94889 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL18O94889 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL18O94889 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL18O94889 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL18O94889 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL18O94889 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL18O94889 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL18O94889 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL18O94889 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL18O94889 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL18O94889 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL18O94889 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL18O94889 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL18O94889 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL18O94889 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL18O94889 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL18O94889 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL18O94889 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL18O94889 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL18O94889 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL18O94889 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL18O94889 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL18O94889 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL18O94889 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL18O94889 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL18O94889 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL18O94889 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL18O94889 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL18O94889 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL18O94889 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL18O94889 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL18O94889 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL18O94889 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL18O94889 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL18O94889 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL18O94889 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL18O94889 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL18O94889 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL18O94889 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL18O94889 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL18O94889 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL18O94889 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL18O94889 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL18O94889 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL18O94889 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL18O94889 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL18O94889 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL18O94889 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL18O94889 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL18O94889 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL18O94889 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL18O94889 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL18O94889 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL18O94889 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL18O94889 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL18O94889 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL18O94889 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL18O94889 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL18O94889 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL18O94889 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL18O94889 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL18O94889 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL18O94889 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL18O94889 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL18O94889 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL18O94889 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL18O94889 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL18O94889 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL18O94889 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL18O94889 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL18O94889 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL18O94889 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL18O94889 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL18O94889 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL18O94889 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL18O94889 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL18O94889 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL18O94889 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL18O94889 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL18O94889 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms