Protein–RNA interactions for Protein: O75461

E2F6, Transcription factor E2F6, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F6O75461 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
E2F6O75461 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
E2F6O75461 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
E2F6O75461 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
E2F6O75461 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
E2F6O75461 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
E2F6O75461 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
E2F6O75461 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
E2F6O75461 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
E2F6O75461 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
E2F6O75461 CFAP65-203ENST00000409865 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
E2F6O75461 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
E2F6O75461 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
E2F6O75461 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
E2F6O75461 Z99774.1-201ENST00000382641 2613 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
E2F6O75461 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
E2F6O75461 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
E2F6O75461 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
E2F6O75461 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
E2F6O75461 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
E2F6O75461 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
E2F6O75461 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
E2F6O75461 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
E2F6O75461 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
E2F6O75461 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
E2F6O75461 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
E2F6O75461 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
E2F6O75461 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
E2F6O75461 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
E2F6O75461 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
E2F6O75461 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
E2F6O75461 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
E2F6O75461 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
E2F6O75461 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
E2F6O75461 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
E2F6O75461 RGS12-202ENST00000338806 3010 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
E2F6O75461 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
E2F6O75461 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
E2F6O75461 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
E2F6O75461 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
E2F6O75461 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
E2F6O75461 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
E2F6O75461 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
E2F6O75461 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
E2F6O75461 AL031728.1-201ENST00000449034 2479 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
E2F6O75461 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
E2F6O75461 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
E2F6O75461 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
E2F6O75461 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
E2F6O75461 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
E2F6O75461 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
E2F6O75461 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
E2F6O75461 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
E2F6O75461 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
E2F6O75461 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
E2F6O75461 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
E2F6O75461 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
E2F6O75461 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
E2F6O75461 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
E2F6O75461 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
E2F6O75461 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
E2F6O75461 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
E2F6O75461 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
E2F6O75461 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
E2F6O75461 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
E2F6O75461 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
E2F6O75461 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
E2F6O75461 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
E2F6O75461 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
E2F6O75461 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
E2F6O75461 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
E2F6O75461 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
E2F6O75461 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
E2F6O75461 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
E2F6O75461 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
E2F6O75461 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
E2F6O75461 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
E2F6O75461 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
E2F6O75461 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
E2F6O75461 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
E2F6O75461 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
E2F6O75461 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
E2F6O75461 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
E2F6O75461 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
E2F6O75461 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
E2F6O75461 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
E2F6O75461 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
E2F6O75461 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
E2F6O75461 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
E2F6O75461 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
E2F6O75461 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
E2F6O75461 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
E2F6O75461 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
E2F6O75461 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
E2F6O75461 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
E2F6O75461 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
E2F6O75461 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
E2F6O75461 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
E2F6O75461 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
E2F6O75461 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms