Protein–RNA interactions for Protein: O43900

PRICKLE3, Prickle planar cell polarity protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRICKLE3O43900 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRICKLE3O43900 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRICKLE3O43900 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PRICKLE3O43900 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRICKLE3O43900 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRICKLE3O43900 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRICKLE3O43900 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRICKLE3O43900 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRICKLE3O43900 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRICKLE3O43900 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRICKLE3O43900 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRICKLE3O43900 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRICKLE3O43900 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRICKLE3O43900 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRICKLE3O43900 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRICKLE3O43900 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRICKLE3O43900 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRICKLE3O43900 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRICKLE3O43900 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRICKLE3O43900 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRICKLE3O43900 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRICKLE3O43900 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRICKLE3O43900 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRICKLE3O43900 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRICKLE3O43900 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRICKLE3O43900 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PRICKLE3O43900 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRICKLE3O43900 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRICKLE3O43900 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRICKLE3O43900 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRICKLE3O43900 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRICKLE3O43900 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRICKLE3O43900 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRICKLE3O43900 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRICKLE3O43900 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PRICKLE3O43900 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PRICKLE3O43900 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRICKLE3O43900 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRICKLE3O43900 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRICKLE3O43900 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRICKLE3O43900 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRICKLE3O43900 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRICKLE3O43900 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRICKLE3O43900 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRICKLE3O43900 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRICKLE3O43900 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRICKLE3O43900 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRICKLE3O43900 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRICKLE3O43900 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRICKLE3O43900 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PRICKLE3O43900 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRICKLE3O43900 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRICKLE3O43900 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRICKLE3O43900 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRICKLE3O43900 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRICKLE3O43900 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRICKLE3O43900 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRICKLE3O43900 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRICKLE3O43900 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRICKLE3O43900 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRICKLE3O43900 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRICKLE3O43900 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRICKLE3O43900 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRICKLE3O43900 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRICKLE3O43900 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRICKLE3O43900 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRICKLE3O43900 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRICKLE3O43900 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRICKLE3O43900 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRICKLE3O43900 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRICKLE3O43900 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRICKLE3O43900 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRICKLE3O43900 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRICKLE3O43900 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRICKLE3O43900 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRICKLE3O43900 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PRICKLE3O43900 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRICKLE3O43900 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRICKLE3O43900 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRICKLE3O43900 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRICKLE3O43900 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRICKLE3O43900 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRICKLE3O43900 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRICKLE3O43900 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRICKLE3O43900 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRICKLE3O43900 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRICKLE3O43900 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRICKLE3O43900 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRICKLE3O43900 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRICKLE3O43900 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRICKLE3O43900 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRICKLE3O43900 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRICKLE3O43900 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRICKLE3O43900 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRICKLE3O43900 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRICKLE3O43900 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRICKLE3O43900 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRICKLE3O43900 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRICKLE3O43900 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRICKLE3O43900 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.9 ms