Protein–RNA interactions for Protein: O43852

CALU, Calumenin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALUO43852 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CALUO43852 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CALUO43852 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CALUO43852 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CALUO43852 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CALUO43852 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CALUO43852 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CALUO43852 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CALUO43852 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CALUO43852 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CALUO43852 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CALUO43852 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CALUO43852 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CALUO43852 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CALUO43852 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CALUO43852 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CALUO43852 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CALUO43852 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CALUO43852 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CALUO43852 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CALUO43852 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CALUO43852 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CALUO43852 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CALUO43852 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CALUO43852 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CALUO43852 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CALUO43852 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CALUO43852 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CALUO43852 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CALUO43852 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CALUO43852 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CALUO43852 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CALUO43852 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CALUO43852 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CALUO43852 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CALUO43852 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CALUO43852 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CALUO43852 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CALUO43852 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CALUO43852 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CALUO43852 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CALUO43852 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CALUO43852 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CALUO43852 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CALUO43852 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CALUO43852 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CALUO43852 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CALUO43852 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CALUO43852 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CALUO43852 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CALUO43852 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CALUO43852 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CALUO43852 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CALUO43852 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CALUO43852 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CALUO43852 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CALUO43852 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CALUO43852 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CALUO43852 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CALUO43852 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CALUO43852 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CALUO43852 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CALUO43852 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CALUO43852 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CALUO43852 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CALUO43852 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CALUO43852 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CALUO43852 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CALUO43852 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CALUO43852 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CALUO43852 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CALUO43852 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CALUO43852 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CALUO43852 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CALUO43852 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CALUO43852 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CALUO43852 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CALUO43852 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CALUO43852 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CALUO43852 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CALUO43852 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CALUO43852 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CALUO43852 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CALUO43852 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CALUO43852 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CALUO43852 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CALUO43852 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CALUO43852 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CALUO43852 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CALUO43852 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CALUO43852 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CALUO43852 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CALUO43852 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CALUO43852 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CALUO43852 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CALUO43852 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CALUO43852 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CALUO43852 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CALUO43852 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CALUO43852 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61 ms