Protein–RNA interactions for Protein: O43711

TLX3, T-cell leukemia homeobox protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLX3O43711 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TLX3O43711 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TLX3O43711 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TLX3O43711 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TLX3O43711 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TLX3O43711 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TLX3O43711 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TLX3O43711 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TLX3O43711 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TLX3O43711 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TLX3O43711 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TLX3O43711 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TLX3O43711 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TLX3O43711 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TLX3O43711 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TLX3O43711 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TLX3O43711 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TLX3O43711 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
TLX3O43711 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TLX3O43711 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TLX3O43711 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TLX3O43711 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TLX3O43711 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TLX3O43711 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TLX3O43711 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TLX3O43711 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TLX3O43711 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TLX3O43711 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TLX3O43711 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TLX3O43711 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TLX3O43711 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TLX3O43711 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TLX3O43711 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TLX3O43711 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TLX3O43711 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TLX3O43711 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TLX3O43711 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TLX3O43711 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TLX3O43711 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TLX3O43711 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TLX3O43711 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TLX3O43711 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TLX3O43711 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TLX3O43711 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TLX3O43711 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TLX3O43711 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TLX3O43711 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TLX3O43711 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TLX3O43711 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TLX3O43711 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TLX3O43711 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TLX3O43711 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TLX3O43711 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TLX3O43711 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TLX3O43711 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TLX3O43711 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TLX3O43711 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TLX3O43711 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TLX3O43711 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TLX3O43711 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TLX3O43711 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TLX3O43711 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TLX3O43711 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TLX3O43711 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TLX3O43711 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TLX3O43711 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TLX3O43711 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TLX3O43711 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TLX3O43711 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TLX3O43711 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TLX3O43711 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TLX3O43711 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TLX3O43711 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TLX3O43711 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TLX3O43711 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TLX3O43711 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TLX3O43711 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TLX3O43711 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TLX3O43711 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TLX3O43711 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TLX3O43711 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TLX3O43711 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
TLX3O43711 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TLX3O43711 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TLX3O43711 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TLX3O43711 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TLX3O43711 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TLX3O43711 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TLX3O43711 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TLX3O43711 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TLX3O43711 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TLX3O43711 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TLX3O43711 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TLX3O43711 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TLX3O43711 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TLX3O43711 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TLX3O43711 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TLX3O43711 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TLX3O43711 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TLX3O43711 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms