Protein–RNA interactions for Protein: O43583

DENR, Density-regulated protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENRO43583 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
DENRO43583 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
DENRO43583 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
DENRO43583 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
DENRO43583 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
DENRO43583 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
DENRO43583 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
DENRO43583 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
DENRO43583 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
DENRO43583 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
DENRO43583 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
DENRO43583 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
DENRO43583 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
DENRO43583 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
DENRO43583 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
DENRO43583 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
DENRO43583 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
DENRO43583 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
DENRO43583 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
DENRO43583 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
DENRO43583 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
DENRO43583 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
DENRO43583 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
DENRO43583 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
DENRO43583 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
DENRO43583 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
DENRO43583 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
DENRO43583 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
DENRO43583 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
DENRO43583 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
DENRO43583 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
DENRO43583 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
DENRO43583 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
DENRO43583 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
DENRO43583 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
DENRO43583 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
DENRO43583 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
DENRO43583 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
DENRO43583 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
DENRO43583 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
DENRO43583 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
DENRO43583 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
DENRO43583 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
DENRO43583 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
DENRO43583 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
DENRO43583 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
DENRO43583 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
DENRO43583 DSN1-207ENST00000448110 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
DENRO43583 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
DENRO43583 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
DENRO43583 HBP1-212ENST00000485846 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
DENRO43583 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
DENRO43583 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
DENRO43583 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
DENRO43583 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
DENRO43583 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
DENRO43583 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
DENRO43583 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
DENRO43583 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
DENRO43583 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
DENRO43583 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
DENRO43583 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
DENRO43583 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
DENRO43583 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
DENRO43583 IGHG3-202ENST00000641136 2751 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
DENRO43583 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
DENRO43583 TCAF2-202ENST00000411935 2906 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
DENRO43583 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
DENRO43583 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
DENRO43583 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
DENRO43583 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
DENRO43583 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
DENRO43583 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
DENRO43583 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
DENRO43583 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
DENRO43583 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
DENRO43583 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
DENRO43583 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
DENRO43583 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
DENRO43583 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
DENRO43583 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
DENRO43583 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
DENRO43583 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
DENRO43583 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
DENRO43583 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
DENRO43583 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
DENRO43583 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
DENRO43583 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
DENRO43583 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
DENRO43583 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
DENRO43583 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
DENRO43583 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
DENRO43583 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
DENRO43583 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
DENRO43583 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
DENRO43583 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
DENRO43583 C8orf31-201ENST00000395172 1875 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
DENRO43583 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
DENRO43583 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
DENRO43583 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms