Protein–RNA interactions for Protein: O43541

SMAD6, Mothers against decapentaplegic homolog 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD6O43541 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
SMAD6O43541 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
SMAD6O43541 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SMAD6O43541 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
SMAD6O43541 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SMAD6O43541 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SMAD6O43541 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SMAD6O43541 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
SMAD6O43541 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SMAD6O43541 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMAD6O43541 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SMAD6O43541 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SMAD6O43541 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMAD6O43541 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SMAD6O43541 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMAD6O43541 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMAD6O43541 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SMAD6O43541 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMAD6O43541 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMAD6O43541 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMAD6O43541 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMAD6O43541 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SMAD6O43541 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SMAD6O43541 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMAD6O43541 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMAD6O43541 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMAD6O43541 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMAD6O43541 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMAD6O43541 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMAD6O43541 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMAD6O43541 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMAD6O43541 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMAD6O43541 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMAD6O43541 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMAD6O43541 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMAD6O43541 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMAD6O43541 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMAD6O43541 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMAD6O43541 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMAD6O43541 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMAD6O43541 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMAD6O43541 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMAD6O43541 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMAD6O43541 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMAD6O43541 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMAD6O43541 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMAD6O43541 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMAD6O43541 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMAD6O43541 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMAD6O43541 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMAD6O43541 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMAD6O43541 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMAD6O43541 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMAD6O43541 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMAD6O43541 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMAD6O43541 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMAD6O43541 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMAD6O43541 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMAD6O43541 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMAD6O43541 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SMAD6O43541 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMAD6O43541 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMAD6O43541 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMAD6O43541 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMAD6O43541 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMAD6O43541 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMAD6O43541 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMAD6O43541 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMAD6O43541 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMAD6O43541 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMAD6O43541 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMAD6O43541 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SMAD6O43541 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SMAD6O43541 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMAD6O43541 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMAD6O43541 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMAD6O43541 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMAD6O43541 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SMAD6O43541 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMAD6O43541 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMAD6O43541 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SMAD6O43541 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMAD6O43541 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMAD6O43541 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMAD6O43541 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMAD6O43541 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMAD6O43541 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMAD6O43541 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMAD6O43541 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMAD6O43541 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMAD6O43541 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMAD6O43541 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMAD6O43541 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMAD6O43541 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMAD6O43541 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMAD6O43541 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMAD6O43541 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMAD6O43541 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMAD6O43541 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMAD6O43541 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms