Protein–RNA interactions for Protein: O14874

BCKDK, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, humanhuman

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Length 412 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCKDKO14874 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
BCKDKO14874 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BCKDKO14874 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BCKDKO14874 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BCKDKO14874 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BCKDKO14874 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BCKDKO14874 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BCKDKO14874 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BCKDKO14874 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BCKDKO14874 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BCKDKO14874 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BCKDKO14874 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BCKDKO14874 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BCKDKO14874 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BCKDKO14874 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BCKDKO14874 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
BCKDKO14874 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BCKDKO14874 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BCKDKO14874 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BCKDKO14874 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BCKDKO14874 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BCKDKO14874 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BCKDKO14874 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BCKDKO14874 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BCKDKO14874 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BCKDKO14874 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BCKDKO14874 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BCKDKO14874 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BCKDKO14874 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BCKDKO14874 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BCKDKO14874 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BCKDKO14874 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BCKDKO14874 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BCKDKO14874 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BCKDKO14874 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BCKDKO14874 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BCKDKO14874 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
BCKDKO14874 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BCKDKO14874 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BCKDKO14874 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BCKDKO14874 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BCKDKO14874 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BCKDKO14874 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BCKDKO14874 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BCKDKO14874 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BCKDKO14874 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BCKDKO14874 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BCKDKO14874 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BCKDKO14874 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
BCKDKO14874 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BCKDKO14874 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
BCKDKO14874 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BCKDKO14874 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BCKDKO14874 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
BCKDKO14874 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BCKDKO14874 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BCKDKO14874 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BCKDKO14874 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BCKDKO14874 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BCKDKO14874 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BCKDKO14874 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BCKDKO14874 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BCKDKO14874 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BCKDKO14874 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BCKDKO14874 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BCKDKO14874 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BCKDKO14874 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BCKDKO14874 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BCKDKO14874 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BCKDKO14874 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BCKDKO14874 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BCKDKO14874 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BCKDKO14874 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
BCKDKO14874 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
BCKDKO14874 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BCKDKO14874 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BCKDKO14874 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BCKDKO14874 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BCKDKO14874 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BCKDKO14874 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
BCKDKO14874 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BCKDKO14874 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BCKDKO14874 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BCKDKO14874 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
BCKDKO14874 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BCKDKO14874 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BCKDKO14874 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BCKDKO14874 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BCKDKO14874 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BCKDKO14874 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BCKDKO14874 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BCKDKO14874 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BCKDKO14874 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BCKDKO14874 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BCKDKO14874 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BCKDKO14874 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BCKDKO14874 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BCKDKO14874 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BCKDKO14874 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
BCKDKO14874 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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