Protein–RNA interactions for Protein: K7ER74

APOC4-APOC2, APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2K7ER74 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOC4-APOC2K7ER74 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOC4-APOC2K7ER74 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOC4-APOC2K7ER74 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOC4-APOC2K7ER74 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOC4-APOC2K7ER74 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOC4-APOC2K7ER74 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOC4-APOC2K7ER74 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOC4-APOC2K7ER74 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
APOC4-APOC2K7ER74 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOC4-APOC2K7ER74 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOC4-APOC2K7ER74 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
APOC4-APOC2K7ER74 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOC4-APOC2K7ER74 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
APOC4-APOC2K7ER74 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOC4-APOC2K7ER74 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOC4-APOC2K7ER74 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOC4-APOC2K7ER74 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOC4-APOC2K7ER74 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOC4-APOC2K7ER74 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOC4-APOC2K7ER74 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOC4-APOC2K7ER74 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOC4-APOC2K7ER74 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOC4-APOC2K7ER74 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOC4-APOC2K7ER74 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOC4-APOC2K7ER74 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOC4-APOC2K7ER74 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOC4-APOC2K7ER74 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOC4-APOC2K7ER74 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOC4-APOC2K7ER74 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOC4-APOC2K7ER74 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOC4-APOC2K7ER74 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOC4-APOC2K7ER74 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOC4-APOC2K7ER74 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOC4-APOC2K7ER74 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOC4-APOC2K7ER74 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOC4-APOC2K7ER74 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOC4-APOC2K7ER74 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOC4-APOC2K7ER74 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOC4-APOC2K7ER74 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOC4-APOC2K7ER74 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOC4-APOC2K7ER74 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOC4-APOC2K7ER74 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOC4-APOC2K7ER74 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOC4-APOC2K7ER74 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOC4-APOC2K7ER74 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOC4-APOC2K7ER74 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOC4-APOC2K7ER74 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOC4-APOC2K7ER74 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOC4-APOC2K7ER74 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOC4-APOC2K7ER74 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOC4-APOC2K7ER74 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
APOC4-APOC2K7ER74 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
APOC4-APOC2K7ER74 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOC4-APOC2K7ER74 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOC4-APOC2K7ER74 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
APOC4-APOC2K7ER74 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
APOC4-APOC2K7ER74 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
APOC4-APOC2K7ER74 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOC4-APOC2K7ER74 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOC4-APOC2K7ER74 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOC4-APOC2K7ER74 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOC4-APOC2K7ER74 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOC4-APOC2K7ER74 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOC4-APOC2K7ER74 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOC4-APOC2K7ER74 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOC4-APOC2K7ER74 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOC4-APOC2K7ER74 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOC4-APOC2K7ER74 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOC4-APOC2K7ER74 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOC4-APOC2K7ER74 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOC4-APOC2K7ER74 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOC4-APOC2K7ER74 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOC4-APOC2K7ER74 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOC4-APOC2K7ER74 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOC4-APOC2K7ER74 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOC4-APOC2K7ER74 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOC4-APOC2K7ER74 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOC4-APOC2K7ER74 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOC4-APOC2K7ER74 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOC4-APOC2K7ER74 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOC4-APOC2K7ER74 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOC4-APOC2K7ER74 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOC4-APOC2K7ER74 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOC4-APOC2K7ER74 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOC4-APOC2K7ER74 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOC4-APOC2K7ER74 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOC4-APOC2K7ER74 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOC4-APOC2K7ER74 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOC4-APOC2K7ER74 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOC4-APOC2K7ER74 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOC4-APOC2K7ER74 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOC4-APOC2K7ER74 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOC4-APOC2K7ER74 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOC4-APOC2K7ER74 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOC4-APOC2K7ER74 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOC4-APOC2K7ER74 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOC4-APOC2K7ER74 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOC4-APOC2K7ER74 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms