Protein–RNA interactions for Protein: E9PGA6

C1QTNF3-AMACR, C1QTNF3-AMACR readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms