Protein–RNA interactions for Protein: C9JE40

PATL2, Protein PAT1 homolog 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATL2C9JE40 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PATL2C9JE40 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PATL2C9JE40 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PATL2C9JE40 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PATL2C9JE40 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PATL2C9JE40 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PATL2C9JE40 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PATL2C9JE40 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PATL2C9JE40 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PATL2C9JE40 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PATL2C9JE40 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
PATL2C9JE40 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PATL2C9JE40 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PATL2C9JE40 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PATL2C9JE40 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PATL2C9JE40 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PATL2C9JE40 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PATL2C9JE40 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PATL2C9JE40 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PATL2C9JE40 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PATL2C9JE40 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
PATL2C9JE40 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PATL2C9JE40 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PATL2C9JE40 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PATL2C9JE40 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PATL2C9JE40 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PATL2C9JE40 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
PATL2C9JE40 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
PATL2C9JE40 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PATL2C9JE40 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PATL2C9JE40 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PATL2C9JE40 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PATL2C9JE40 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PATL2C9JE40 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
PATL2C9JE40 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PATL2C9JE40 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PATL2C9JE40 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PATL2C9JE40 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PATL2C9JE40 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PATL2C9JE40 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PATL2C9JE40 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PATL2C9JE40 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PATL2C9JE40 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PATL2C9JE40 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PATL2C9JE40 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PATL2C9JE40 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PATL2C9JE40 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PATL2C9JE40 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PATL2C9JE40 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PATL2C9JE40 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PATL2C9JE40 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PATL2C9JE40 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PATL2C9JE40 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PATL2C9JE40 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PATL2C9JE40 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
PATL2C9JE40 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PATL2C9JE40 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
PATL2C9JE40 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PATL2C9JE40 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PATL2C9JE40 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
PATL2C9JE40 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PATL2C9JE40 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PATL2C9JE40 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
PATL2C9JE40 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
PATL2C9JE40 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
PATL2C9JE40 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
PATL2C9JE40 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PATL2C9JE40 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PATL2C9JE40 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PATL2C9JE40 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PATL2C9JE40 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PATL2C9JE40 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PATL2C9JE40 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PATL2C9JE40 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PATL2C9JE40 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PATL2C9JE40 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PATL2C9JE40 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PATL2C9JE40 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PATL2C9JE40 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PATL2C9JE40 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PATL2C9JE40 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PATL2C9JE40 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PATL2C9JE40 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PATL2C9JE40 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PATL2C9JE40 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PATL2C9JE40 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PATL2C9JE40 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PATL2C9JE40 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PATL2C9JE40 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PATL2C9JE40 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PATL2C9JE40 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PATL2C9JE40 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PATL2C9JE40 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PATL2C9JE40 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PATL2C9JE40 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PATL2C9JE40 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PATL2C9JE40 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PATL2C9JE40 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PATL2C9JE40 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PATL2C9JE40 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms