Protein–RNA interactions for Protein: A6NKT7

RGPD3, RanBP2-like and GRIP domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD3A6NKT7 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RGPD3A6NKT7 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RGPD3A6NKT7 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RGPD3A6NKT7 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RGPD3A6NKT7 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
RGPD3A6NKT7 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RGPD3A6NKT7 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RGPD3A6NKT7 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RGPD3A6NKT7 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RGPD3A6NKT7 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RGPD3A6NKT7 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RGPD3A6NKT7 CIDEC-202ENST00000383817 1199 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RGPD3A6NKT7 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RGPD3A6NKT7 AC004973.1-201ENST00000413240 635 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RGPD3A6NKT7 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
RGPD3A6NKT7 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RGPD3A6NKT7 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
RGPD3A6NKT7 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RGPD3A6NKT7 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RGPD3A6NKT7 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RGPD3A6NKT7 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RGPD3A6NKT7 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RGPD3A6NKT7 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RGPD3A6NKT7 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RGPD3A6NKT7 FAM69C-202ENST00000400291 1329 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RGPD3A6NKT7 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RGPD3A6NKT7 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
RGPD3A6NKT7 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
RGPD3A6NKT7 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
RGPD3A6NKT7 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
RGPD3A6NKT7 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
RGPD3A6NKT7 AC108199.1-201ENST00000504249 508 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.71
RGPD3A6NKT7 C15orf59-AS1-202ENST00000615095 1224 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
RGPD3A6NKT7 AC105137.3-201ENST00000617588 984 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
RGPD3A6NKT7 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.71
RGPD3A6NKT7 AL132780.4-201ENST00000624870 1135 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
RGPD3A6NKT7 GLUD1P2-203ENST00000631118 486 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.71
RGPD3A6NKT7 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
RGPD3A6NKT7 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
RGPD3A6NKT7 FHL2-206ENST00000408995 1367 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
RGPD3A6NKT7 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RGPD3A6NKT7 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RGPD3A6NKT7 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RGPD3A6NKT7 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RGPD3A6NKT7 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RGPD3A6NKT7 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RGPD3A6NKT7 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RGPD3A6NKT7 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RGPD3A6NKT7 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RGPD3A6NKT7 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RGPD3A6NKT7 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RGPD3A6NKT7 AC008687.1-201ENST00000591656 786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RGPD3A6NKT7 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
RGPD3A6NKT7 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
RGPD3A6NKT7 SLC25A19-205ENST00000442286 1496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RGPD3A6NKT7 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RGPD3A6NKT7 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RGPD3A6NKT7 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RGPD3A6NKT7 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RGPD3A6NKT7 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RGPD3A6NKT7 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RGPD3A6NKT7 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
RGPD3A6NKT7 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
RGPD3A6NKT7 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
RGPD3A6NKT7 PIGL-201ENST00000225609 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RGPD3A6NKT7 CMTM5-201ENST00000339180 1173 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RGPD3A6NKT7 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RGPD3A6NKT7 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RGPD3A6NKT7 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
RGPD3A6NKT7 AC026410.1-201ENST00000507366 1101 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
RGPD3A6NKT7 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RGPD3A6NKT7 AL118516.1-201ENST00000564152 670 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
RGPD3A6NKT7 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
RGPD3A6NKT7 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
RGPD3A6NKT7 FO393412.1-201ENST00000619841 382 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
RGPD3A6NKT7 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RGPD3A6NKT7 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RGPD3A6NKT7 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RGPD3A6NKT7 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RGPD3A6NKT7 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RGPD3A6NKT7 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RGPD3A6NKT7 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RGPD3A6NKT7 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RGPD3A6NKT7 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RGPD3A6NKT7 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RGPD3A6NKT7 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RGPD3A6NKT7 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RGPD3A6NKT7 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RGPD3A6NKT7 CMTM5-202ENST00000342473 725 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RGPD3A6NKT7 CMTM5-205ENST00000397227 818 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RGPD3A6NKT7 AL591242.1-203ENST00000434329 374 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RGPD3A6NKT7 AC018463.1-201ENST00000456674 917 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
RGPD3A6NKT7 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RGPD3A6NKT7 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RGPD3A6NKT7 CMTM5-208ENST00000555731 831 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RGPD3A6NKT7 AC073911.3-201ENST00000624401 631 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
RGPD3A6NKT7 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RGPD3A6NKT7 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RGPD3A6NKT7 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RGPD3A6NKT7 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms