Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF2

ARID3C, AT-rich interactive domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3CA6NKF2 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ARID3CA6NKF2 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ARID3CA6NKF2 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ARID3CA6NKF2 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ARID3CA6NKF2 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ARID3CA6NKF2 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
ARID3CA6NKF2 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ARID3CA6NKF2 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ARID3CA6NKF2 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ARID3CA6NKF2 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
ARID3CA6NKF2 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
ARID3CA6NKF2 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ARID3CA6NKF2 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ARID3CA6NKF2 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ARID3CA6NKF2 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ARID3CA6NKF2 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ARID3CA6NKF2 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ARID3CA6NKF2 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ARID3CA6NKF2 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ARID3CA6NKF2 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ARID3CA6NKF2 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ARID3CA6NKF2 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ARID3CA6NKF2 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ARID3CA6NKF2 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
ARID3CA6NKF2 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ARID3CA6NKF2 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ARID3CA6NKF2 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ARID3CA6NKF2 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ARID3CA6NKF2 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ARID3CA6NKF2 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ARID3CA6NKF2 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ARID3CA6NKF2 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ARID3CA6NKF2 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ARID3CA6NKF2 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
ARID3CA6NKF2 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
ARID3CA6NKF2 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ARID3CA6NKF2 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ARID3CA6NKF2 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ARID3CA6NKF2 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ARID3CA6NKF2 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ARID3CA6NKF2 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ARID3CA6NKF2 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ARID3CA6NKF2 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ARID3CA6NKF2 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ARID3CA6NKF2 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ARID3CA6NKF2 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ARID3CA6NKF2 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ARID3CA6NKF2 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ARID3CA6NKF2 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
ARID3CA6NKF2 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ARID3CA6NKF2 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
ARID3CA6NKF2 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ARID3CA6NKF2 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ARID3CA6NKF2 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ARID3CA6NKF2 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ARID3CA6NKF2 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ARID3CA6NKF2 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ARID3CA6NKF2 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ARID3CA6NKF2 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ARID3CA6NKF2 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ARID3CA6NKF2 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ARID3CA6NKF2 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ARID3CA6NKF2 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ARID3CA6NKF2 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ARID3CA6NKF2 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ARID3CA6NKF2 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
ARID3CA6NKF2 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ARID3CA6NKF2 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ARID3CA6NKF2 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ARID3CA6NKF2 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ARID3CA6NKF2 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
ARID3CA6NKF2 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ARID3CA6NKF2 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ARID3CA6NKF2 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
ARID3CA6NKF2 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ARID3CA6NKF2 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ARID3CA6NKF2 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ARID3CA6NKF2 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ARID3CA6NKF2 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ARID3CA6NKF2 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ARID3CA6NKF2 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ARID3CA6NKF2 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ARID3CA6NKF2 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ARID3CA6NKF2 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ARID3CA6NKF2 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ARID3CA6NKF2 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ARID3CA6NKF2 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ARID3CA6NKF2 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ARID3CA6NKF2 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ARID3CA6NKF2 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ARID3CA6NKF2 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ARID3CA6NKF2 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ARID3CA6NKF2 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ARID3CA6NKF2 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ARID3CA6NKF2 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ARID3CA6NKF2 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
ARID3CA6NKF2 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ARID3CA6NKF2 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ARID3CA6NKF2 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ARID3CA6NKF2 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms