Protein–RNA interactions for Protein: A2IDD5

CCDC78, Coiled-coil domain-containing protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC78A2IDD5 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC78A2IDD5 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC78A2IDD5 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC78A2IDD5 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC78A2IDD5 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC78A2IDD5 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC78A2IDD5 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC78A2IDD5 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC78A2IDD5 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC78A2IDD5 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC78A2IDD5 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC78A2IDD5 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC78A2IDD5 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC78A2IDD5 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC78A2IDD5 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC78A2IDD5 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC78A2IDD5 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC78A2IDD5 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC78A2IDD5 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC78A2IDD5 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC78A2IDD5 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC78A2IDD5 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC78A2IDD5 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC78A2IDD5 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC78A2IDD5 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC78A2IDD5 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC78A2IDD5 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC78A2IDD5 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC78A2IDD5 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC78A2IDD5 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC78A2IDD5 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC78A2IDD5 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC78A2IDD5 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC78A2IDD5 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC78A2IDD5 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC78A2IDD5 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC78A2IDD5 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC78A2IDD5 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC78A2IDD5 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC78A2IDD5 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC78A2IDD5 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC78A2IDD5 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC78A2IDD5 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC78A2IDD5 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC78A2IDD5 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC78A2IDD5 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC78A2IDD5 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC78A2IDD5 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC78A2IDD5 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC78A2IDD5 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC78A2IDD5 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC78A2IDD5 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC78A2IDD5 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC78A2IDD5 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC78A2IDD5 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC78A2IDD5 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC78A2IDD5 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC78A2IDD5 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC78A2IDD5 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC78A2IDD5 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC78A2IDD5 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC78A2IDD5 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC78A2IDD5 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC78A2IDD5 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC78A2IDD5 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC78A2IDD5 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC78A2IDD5 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC78A2IDD5 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC78A2IDD5 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC78A2IDD5 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC78A2IDD5 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC78A2IDD5 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC78A2IDD5 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC78A2IDD5 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC78A2IDD5 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC78A2IDD5 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC78A2IDD5 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC78A2IDD5 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC78A2IDD5 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC78A2IDD5 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC78A2IDD5 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC78A2IDD5 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC78A2IDD5 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC78A2IDD5 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC78A2IDD5 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC78A2IDD5 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC78A2IDD5 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC78A2IDD5 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC78A2IDD5 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC78A2IDD5 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC78A2IDD5 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC78A2IDD5 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC78A2IDD5 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC78A2IDD5 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC78A2IDD5 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC78A2IDD5 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC78A2IDD5 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC78A2IDD5 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC78A2IDD5 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC78A2IDD5 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms