Protein–RNA interactions for Protein: A0AVT1

UBA6, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBA6A0AVT1 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
UBA6A0AVT1 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBA6A0AVT1 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBA6A0AVT1 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBA6A0AVT1 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBA6A0AVT1 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
UBA6A0AVT1 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
UBA6A0AVT1 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBA6A0AVT1 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
UBA6A0AVT1 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBA6A0AVT1 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
UBA6A0AVT1 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBA6A0AVT1 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBA6A0AVT1 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC16■□□□□ 0.15
UBA6A0AVT1 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBA6A0AVT1 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
UBA6A0AVT1 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
UBA6A0AVT1 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
UBA6A0AVT1 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
UBA6A0AVT1 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
UBA6A0AVT1 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC16■□□□□ 0.15
UBA6A0AVT1 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
UBA6A0AVT1 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBA6A0AVT1 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
UBA6A0AVT1 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBA6A0AVT1 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBA6A0AVT1 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBA6A0AVT1 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBA6A0AVT1 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBA6A0AVT1 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBA6A0AVT1 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBA6A0AVT1 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
UBA6A0AVT1 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
UBA6A0AVT1 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBA6A0AVT1 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBA6A0AVT1 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBA6A0AVT1 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBA6A0AVT1 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBA6A0AVT1 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBA6A0AVT1 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBA6A0AVT1 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBA6A0AVT1 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBA6A0AVT1 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBA6A0AVT1 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBA6A0AVT1 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBA6A0AVT1 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBA6A0AVT1 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBA6A0AVT1 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBA6A0AVT1 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBA6A0AVT1 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
UBA6A0AVT1 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBA6A0AVT1 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBA6A0AVT1 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBA6A0AVT1 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBA6A0AVT1 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBA6A0AVT1 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBA6A0AVT1 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBA6A0AVT1 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBA6A0AVT1 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
UBA6A0AVT1 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBA6A0AVT1 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBA6A0AVT1 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBA6A0AVT1 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBA6A0AVT1 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBA6A0AVT1 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBA6A0AVT1 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBA6A0AVT1 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBA6A0AVT1 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBA6A0AVT1 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBA6A0AVT1 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBA6A0AVT1 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBA6A0AVT1 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBA6A0AVT1 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBA6A0AVT1 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBA6A0AVT1 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBA6A0AVT1 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBA6A0AVT1 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBA6A0AVT1 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBA6A0AVT1 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBA6A0AVT1 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBA6A0AVT1 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBA6A0AVT1 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBA6A0AVT1 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBA6A0AVT1 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBA6A0AVT1 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBA6A0AVT1 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBA6A0AVT1 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBA6A0AVT1 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBA6A0AVT1 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBA6A0AVT1 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBA6A0AVT1 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBA6A0AVT1 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBA6A0AVT1 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBA6A0AVT1 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBA6A0AVT1 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBA6A0AVT1 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBA6A0AVT1 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBA6A0AVT1 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBA6A0AVT1 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBA6A0AVT1 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms