Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5S2

CDC42BPB, Serine/threonine-protein kinase MRCK beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,711 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42BPBQ9Y5S2 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDC42BPBQ9Y5S2 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDC42BPBQ9Y5S2 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDC42BPBQ9Y5S2 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDC42BPBQ9Y5S2 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDC42BPBQ9Y5S2 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDC42BPBQ9Y5S2 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDC42BPBQ9Y5S2 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDC42BPBQ9Y5S2 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDC42BPBQ9Y5S2 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDC42BPBQ9Y5S2 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDC42BPBQ9Y5S2 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDC42BPBQ9Y5S2 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDC42BPBQ9Y5S2 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CDC42BPBQ9Y5S2 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDC42BPBQ9Y5S2 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDC42BPBQ9Y5S2 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CDC42BPBQ9Y5S2 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDC42BPBQ9Y5S2 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CDC42BPBQ9Y5S2 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CDC42BPBQ9Y5S2 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDC42BPBQ9Y5S2 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDC42BPBQ9Y5S2 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDC42BPBQ9Y5S2 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CDC42BPBQ9Y5S2 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDC42BPBQ9Y5S2 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDC42BPBQ9Y5S2 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDC42BPBQ9Y5S2 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDC42BPBQ9Y5S2 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDC42BPBQ9Y5S2 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDC42BPBQ9Y5S2 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDC42BPBQ9Y5S2 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDC42BPBQ9Y5S2 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDC42BPBQ9Y5S2 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDC42BPBQ9Y5S2 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDC42BPBQ9Y5S2 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDC42BPBQ9Y5S2 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDC42BPBQ9Y5S2 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDC42BPBQ9Y5S2 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CDC42BPBQ9Y5S2 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDC42BPBQ9Y5S2 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDC42BPBQ9Y5S2 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDC42BPBQ9Y5S2 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CDC42BPBQ9Y5S2 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDC42BPBQ9Y5S2 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDC42BPBQ9Y5S2 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CDC42BPBQ9Y5S2 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CDC42BPBQ9Y5S2 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDC42BPBQ9Y5S2 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDC42BPBQ9Y5S2 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDC42BPBQ9Y5S2 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDC42BPBQ9Y5S2 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDC42BPBQ9Y5S2 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDC42BPBQ9Y5S2 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDC42BPBQ9Y5S2 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDC42BPBQ9Y5S2 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDC42BPBQ9Y5S2 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDC42BPBQ9Y5S2 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDC42BPBQ9Y5S2 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CDC42BPBQ9Y5S2 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDC42BPBQ9Y5S2 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDC42BPBQ9Y5S2 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDC42BPBQ9Y5S2 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDC42BPBQ9Y5S2 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDC42BPBQ9Y5S2 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDC42BPBQ9Y5S2 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDC42BPBQ9Y5S2 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDC42BPBQ9Y5S2 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDC42BPBQ9Y5S2 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDC42BPBQ9Y5S2 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDC42BPBQ9Y5S2 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDC42BPBQ9Y5S2 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDC42BPBQ9Y5S2 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDC42BPBQ9Y5S2 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDC42BPBQ9Y5S2 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDC42BPBQ9Y5S2 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDC42BPBQ9Y5S2 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDC42BPBQ9Y5S2 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDC42BPBQ9Y5S2 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDC42BPBQ9Y5S2 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDC42BPBQ9Y5S2 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDC42BPBQ9Y5S2 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDC42BPBQ9Y5S2 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDC42BPBQ9Y5S2 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDC42BPBQ9Y5S2 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDC42BPBQ9Y5S2 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CDC42BPBQ9Y5S2 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CDC42BPBQ9Y5S2 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CDC42BPBQ9Y5S2 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDC42BPBQ9Y5S2 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDC42BPBQ9Y5S2 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDC42BPBQ9Y5S2 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDC42BPBQ9Y5S2 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDC42BPBQ9Y5S2 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CDC42BPBQ9Y5S2 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDC42BPBQ9Y5S2 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDC42BPBQ9Y5S2 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDC42BPBQ9Y5S2 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDC42BPBQ9Y5S2 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CDC42BPBQ9Y5S2 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms