Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3C4

TPRKB, EKC/KEOPS complex subunit TPRKB, humanhuman

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Length 175 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRKBQ9Y3C4 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TPRKBQ9Y3C4 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TPRKBQ9Y3C4 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TPRKBQ9Y3C4 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TPRKBQ9Y3C4 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TPRKBQ9Y3C4 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TPRKBQ9Y3C4 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TPRKBQ9Y3C4 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TPRKBQ9Y3C4 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TPRKBQ9Y3C4 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TPRKBQ9Y3C4 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TPRKBQ9Y3C4 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TPRKBQ9Y3C4 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TPRKBQ9Y3C4 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TPRKBQ9Y3C4 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TPRKBQ9Y3C4 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TPRKBQ9Y3C4 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TPRKBQ9Y3C4 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TPRKBQ9Y3C4 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TPRKBQ9Y3C4 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TPRKBQ9Y3C4 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TPRKBQ9Y3C4 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TPRKBQ9Y3C4 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TPRKBQ9Y3C4 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TPRKBQ9Y3C4 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TPRKBQ9Y3C4 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TPRKBQ9Y3C4 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TPRKBQ9Y3C4 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TPRKBQ9Y3C4 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TPRKBQ9Y3C4 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TPRKBQ9Y3C4 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TPRKBQ9Y3C4 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TPRKBQ9Y3C4 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TPRKBQ9Y3C4 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TPRKBQ9Y3C4 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TPRKBQ9Y3C4 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TPRKBQ9Y3C4 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TPRKBQ9Y3C4 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TPRKBQ9Y3C4 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TPRKBQ9Y3C4 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TPRKBQ9Y3C4 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TPRKBQ9Y3C4 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
TPRKBQ9Y3C4 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TPRKBQ9Y3C4 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TPRKBQ9Y3C4 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
TPRKBQ9Y3C4 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TPRKBQ9Y3C4 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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TPRKBQ9Y3C4 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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TPRKBQ9Y3C4 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TPRKBQ9Y3C4 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
TPRKBQ9Y3C4 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
TPRKBQ9Y3C4 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TPRKBQ9Y3C4 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
TPRKBQ9Y3C4 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TPRKBQ9Y3C4 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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TPRKBQ9Y3C4 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
TPRKBQ9Y3C4 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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TPRKBQ9Y3C4 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TPRKBQ9Y3C4 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TPRKBQ9Y3C4 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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TPRKBQ9Y3C4 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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TPRKBQ9Y3C4 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
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TPRKBQ9Y3C4 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
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TPRKBQ9Y3C4 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
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TPRKBQ9Y3C4 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TPRKBQ9Y3C4 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TPRKBQ9Y3C4 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TPRKBQ9Y3C4 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TPRKBQ9Y3C4 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TPRKBQ9Y3C4 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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TPRKBQ9Y3C4 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
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TPRKBQ9Y3C4 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TPRKBQ9Y3C4 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
TPRKBQ9Y3C4 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TPRKBQ9Y3C4 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TPRKBQ9Y3C4 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TPRKBQ9Y3C4 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TPRKBQ9Y3C4 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TPRKBQ9Y3C4 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TPRKBQ9Y3C4 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TPRKBQ9Y3C4 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TPRKBQ9Y3C4 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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