Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y244

POMP, Proteasome maturation protein, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POMPQ9Y244 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
POMPQ9Y244 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
POMPQ9Y244 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
POMPQ9Y244 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
POMPQ9Y244 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
POMPQ9Y244 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
POMPQ9Y244 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
POMPQ9Y244 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
POMPQ9Y244 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
POMPQ9Y244 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
POMPQ9Y244 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
POMPQ9Y244 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
POMPQ9Y244 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
POMPQ9Y244 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
POMPQ9Y244 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
POMPQ9Y244 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
POMPQ9Y244 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
POMPQ9Y244 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
POMPQ9Y244 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
POMPQ9Y244 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
POMPQ9Y244 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
POMPQ9Y244 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
POMPQ9Y244 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
POMPQ9Y244 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
POMPQ9Y244 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
POMPQ9Y244 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
POMPQ9Y244 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
POMPQ9Y244 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
POMPQ9Y244 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
POMPQ9Y244 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
POMPQ9Y244 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
POMPQ9Y244 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
POMPQ9Y244 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
POMPQ9Y244 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
POMPQ9Y244 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
POMPQ9Y244 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
POMPQ9Y244 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
POMPQ9Y244 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
POMPQ9Y244 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
POMPQ9Y244 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
POMPQ9Y244 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
POMPQ9Y244 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
POMPQ9Y244 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
POMPQ9Y244 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
POMPQ9Y244 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
POMPQ9Y244 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
POMPQ9Y244 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
POMPQ9Y244 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
POMPQ9Y244 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
POMPQ9Y244 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
POMPQ9Y244 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
POMPQ9Y244 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
POMPQ9Y244 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
POMPQ9Y244 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
POMPQ9Y244 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
POMPQ9Y244 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
POMPQ9Y244 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
POMPQ9Y244 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
POMPQ9Y244 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
POMPQ9Y244 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
POMPQ9Y244 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
POMPQ9Y244 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
POMPQ9Y244 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
POMPQ9Y244 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
POMPQ9Y244 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
POMPQ9Y244 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
POMPQ9Y244 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
POMPQ9Y244 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
POMPQ9Y244 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
POMPQ9Y244 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
POMPQ9Y244 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
POMPQ9Y244 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
POMPQ9Y244 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
POMPQ9Y244 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
POMPQ9Y244 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
POMPQ9Y244 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
POMPQ9Y244 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
POMPQ9Y244 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
POMPQ9Y244 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
POMPQ9Y244 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
POMPQ9Y244 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
POMPQ9Y244 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
POMPQ9Y244 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
POMPQ9Y244 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
POMPQ9Y244 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
POMPQ9Y244 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
POMPQ9Y244 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
POMPQ9Y244 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
POMPQ9Y244 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
POMPQ9Y244 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
POMPQ9Y244 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
POMPQ9Y244 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
POMPQ9Y244 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
POMPQ9Y244 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
POMPQ9Y244 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
POMPQ9Y244 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
POMPQ9Y244 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
POMPQ9Y244 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
POMPQ9Y244 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
POMPQ9Y244 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms