Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPS6

SETD1B, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD1BQ9UPS6 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SETD1BQ9UPS6 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SETD1BQ9UPS6 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SETD1BQ9UPS6 AC245100.1-201ENST00000452996 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SETD1BQ9UPS6 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SETD1BQ9UPS6 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SETD1BQ9UPS6 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SETD1BQ9UPS6 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SETD1BQ9UPS6 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SETD1BQ9UPS6 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SETD1BQ9UPS6 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SETD1BQ9UPS6 PPIE-202ENST00000356511 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
SETD1BQ9UPS6 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
SETD1BQ9UPS6 CIDEC-202ENST00000383817 1199 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
SETD1BQ9UPS6 Metazoa_SRP.100-201ENST00000447610 282 ntBASIC22.27■■□□□ 1.15
SETD1BQ9UPS6 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
SETD1BQ9UPS6 EMP2-203ENST00000536829 781 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
SETD1BQ9UPS6 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC22.27■■□□□ 1.15
SETD1BQ9UPS6 AC005696.1-201ENST00000572876 443 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
SETD1BQ9UPS6 HS3ST3A1-202ENST00000578576 750 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.15
SETD1BQ9UPS6 AP005901.3-201ENST00000581666 415 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.15
SETD1BQ9UPS6 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC22.27■■□□□ 1.15
SETD1BQ9UPS6 AP003392.6-201ENST00000607709 325 ntBASIC22.27■■□□□ 1.15
SETD1BQ9UPS6 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
SETD1BQ9UPS6 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SETD1BQ9UPS6 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SETD1BQ9UPS6 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SETD1BQ9UPS6 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SETD1BQ9UPS6 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SETD1BQ9UPS6 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SETD1BQ9UPS6 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SETD1BQ9UPS6 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SETD1BQ9UPS6 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SETD1BQ9UPS6 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SETD1BQ9UPS6 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SETD1BQ9UPS6 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SETD1BQ9UPS6 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SETD1BQ9UPS6 PLEKHA8P1-203ENST00000545609 277 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SETD1BQ9UPS6 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SETD1BQ9UPS6 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SETD1BQ9UPS6 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SETD1BQ9UPS6 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SETD1BQ9UPS6 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SETD1BQ9UPS6 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SETD1BQ9UPS6 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SETD1BQ9UPS6 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SETD1BQ9UPS6 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SETD1BQ9UPS6 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SETD1BQ9UPS6 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SETD1BQ9UPS6 TMCO5B-205ENST00000530020 894 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SETD1BQ9UPS6 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SETD1BQ9UPS6 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SETD1BQ9UPS6 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SETD1BQ9UPS6 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SETD1BQ9UPS6 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SETD1BQ9UPS6 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SETD1BQ9UPS6 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SETD1BQ9UPS6 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SETD1BQ9UPS6 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SETD1BQ9UPS6 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SETD1BQ9UPS6 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SETD1BQ9UPS6 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SETD1BQ9UPS6 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SETD1BQ9UPS6 TPM1-223ENST00000560445 485 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SETD1BQ9UPS6 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SETD1BQ9UPS6 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SETD1BQ9UPS6 UXT-AS1-202ENST00000591832 565 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SETD1BQ9UPS6 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SETD1BQ9UPS6 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SETD1BQ9UPS6 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SETD1BQ9UPS6 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SETD1BQ9UPS6 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SETD1BQ9UPS6 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SETD1BQ9UPS6 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SETD1BQ9UPS6 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SETD1BQ9UPS6 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SETD1BQ9UPS6 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SETD1BQ9UPS6 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SETD1BQ9UPS6 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SETD1BQ9UPS6 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SETD1BQ9UPS6 AC104333.4-201ENST00000632866 554 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SETD1BQ9UPS6 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SETD1BQ9UPS6 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SETD1BQ9UPS6 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SETD1BQ9UPS6 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SETD1BQ9UPS6 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SETD1BQ9UPS6 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SETD1BQ9UPS6 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SETD1BQ9UPS6 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SETD1BQ9UPS6 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SETD1BQ9UPS6 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SETD1BQ9UPS6 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SETD1BQ9UPS6 AC079112.1-201ENST00000454972 939 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SETD1BQ9UPS6 REEP5-205ENST00000504247 480 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SETD1BQ9UPS6 REEP5-207ENST00000513339 1139 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SETD1BQ9UPS6 AC009119.2-201ENST00000561562 723 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SETD1BQ9UPS6 NPTN-204ENST00000562924 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SETD1BQ9UPS6 AC007881.3-201ENST00000608897 607 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SETD1BQ9UPS6 GLUD1P2-203ENST00000631118 486 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SETD1BQ9UPS6 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms