Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI42

CPA4, Carboxypeptidase A4, humanhuman

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPA4Q9UI42 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CPA4Q9UI42 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CPA4Q9UI42 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CPA4Q9UI42 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CPA4Q9UI42 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CPA4Q9UI42 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CPA4Q9UI42 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CPA4Q9UI42 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CPA4Q9UI42 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CPA4Q9UI42 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CPA4Q9UI42 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CPA4Q9UI42 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CPA4Q9UI42 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CPA4Q9UI42 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CPA4Q9UI42 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CPA4Q9UI42 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CPA4Q9UI42 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CPA4Q9UI42 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CPA4Q9UI42 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CPA4Q9UI42 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CPA4Q9UI42 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CPA4Q9UI42 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CPA4Q9UI42 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CPA4Q9UI42 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CPA4Q9UI42 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CPA4Q9UI42 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CPA4Q9UI42 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CPA4Q9UI42 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CPA4Q9UI42 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CPA4Q9UI42 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CPA4Q9UI42 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CPA4Q9UI42 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CPA4Q9UI42 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CPA4Q9UI42 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CPA4Q9UI42 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CPA4Q9UI42 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CPA4Q9UI42 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CPA4Q9UI42 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CPA4Q9UI42 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CPA4Q9UI42 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CPA4Q9UI42 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CPA4Q9UI42 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CPA4Q9UI42 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CPA4Q9UI42 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CPA4Q9UI42 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CPA4Q9UI42 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CPA4Q9UI42 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CPA4Q9UI42 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CPA4Q9UI42 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CPA4Q9UI42 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CPA4Q9UI42 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CPA4Q9UI42 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CPA4Q9UI42 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CPA4Q9UI42 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CPA4Q9UI42 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CPA4Q9UI42 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CPA4Q9UI42 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CPA4Q9UI42 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CPA4Q9UI42 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CPA4Q9UI42 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CPA4Q9UI42 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CPA4Q9UI42 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CPA4Q9UI42 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CPA4Q9UI42 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CPA4Q9UI42 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CPA4Q9UI42 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CPA4Q9UI42 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CPA4Q9UI42 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CPA4Q9UI42 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CPA4Q9UI42 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CPA4Q9UI42 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CPA4Q9UI42 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CPA4Q9UI42 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CPA4Q9UI42 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CPA4Q9UI42 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CPA4Q9UI42 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CPA4Q9UI42 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CPA4Q9UI42 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CPA4Q9UI42 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CPA4Q9UI42 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CPA4Q9UI42 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CPA4Q9UI42 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CPA4Q9UI42 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CPA4Q9UI42 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CPA4Q9UI42 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CPA4Q9UI42 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CPA4Q9UI42 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CPA4Q9UI42 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CPA4Q9UI42 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CPA4Q9UI42 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CPA4Q9UI42 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CPA4Q9UI42 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CPA4Q9UI42 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CPA4Q9UI42 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CPA4Q9UI42 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CPA4Q9UI42 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CPA4Q9UI42 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CPA4Q9UI42 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CPA4Q9UI42 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CPA4Q9UI42 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms