Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP35Q9P2H5 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP35Q9P2H5 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
USP35Q9P2H5 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP35Q9P2H5 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP35Q9P2H5 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP35Q9P2H5 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP35Q9P2H5 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP35Q9P2H5 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP35Q9P2H5 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP35Q9P2H5 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP35Q9P2H5 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP35Q9P2H5 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP35Q9P2H5 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP35Q9P2H5 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP35Q9P2H5 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP35Q9P2H5 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP35Q9P2H5 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP35Q9P2H5 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP35Q9P2H5 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP35Q9P2H5 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP35Q9P2H5 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
USP35Q9P2H5 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP35Q9P2H5 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP35Q9P2H5 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP35Q9P2H5 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP35Q9P2H5 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP35Q9P2H5 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP35Q9P2H5 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP35Q9P2H5 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP35Q9P2H5 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
USP35Q9P2H5 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP35Q9P2H5 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP35Q9P2H5 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP35Q9P2H5 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP35Q9P2H5 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
USP35Q9P2H5 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP35Q9P2H5 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP35Q9P2H5 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP35Q9P2H5 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP35Q9P2H5 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP35Q9P2H5 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP35Q9P2H5 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP35Q9P2H5 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP35Q9P2H5 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP35Q9P2H5 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP35Q9P2H5 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP35Q9P2H5 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP35Q9P2H5 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP35Q9P2H5 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP35Q9P2H5 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP35Q9P2H5 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP35Q9P2H5 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP35Q9P2H5 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP35Q9P2H5 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP35Q9P2H5 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
USP35Q9P2H5 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP35Q9P2H5 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP35Q9P2H5 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP35Q9P2H5 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP35Q9P2H5 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP35Q9P2H5 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP35Q9P2H5 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP35Q9P2H5 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP35Q9P2H5 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP35Q9P2H5 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
USP35Q9P2H5 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
USP35Q9P2H5 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP35Q9P2H5 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP35Q9P2H5 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
USP35Q9P2H5 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP35Q9P2H5 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP35Q9P2H5 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP35Q9P2H5 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP35Q9P2H5 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP35Q9P2H5 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP35Q9P2H5 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP35Q9P2H5 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP35Q9P2H5 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP35Q9P2H5 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP35Q9P2H5 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP35Q9P2H5 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP35Q9P2H5 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP35Q9P2H5 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP35Q9P2H5 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP35Q9P2H5 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP35Q9P2H5 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP35Q9P2H5 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP35Q9P2H5 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP35Q9P2H5 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP35Q9P2H5 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP35Q9P2H5 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP35Q9P2H5 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP35Q9P2H5 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP35Q9P2H5 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP35Q9P2H5 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP35Q9P2H5 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP35Q9P2H5 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP35Q9P2H5 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP35Q9P2H5 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
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