Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0L0

VAPA, Vesicle-associated membrane protein-associated protein A, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAPAQ9P0L0 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VAPAQ9P0L0 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
VAPAQ9P0L0 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VAPAQ9P0L0 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VAPAQ9P0L0 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
VAPAQ9P0L0 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
VAPAQ9P0L0 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VAPAQ9P0L0 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
VAPAQ9P0L0 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
VAPAQ9P0L0 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VAPAQ9P0L0 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
VAPAQ9P0L0 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
VAPAQ9P0L0 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VAPAQ9P0L0 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VAPAQ9P0L0 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VAPAQ9P0L0 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VAPAQ9P0L0 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
VAPAQ9P0L0 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VAPAQ9P0L0 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VAPAQ9P0L0 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VAPAQ9P0L0 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VAPAQ9P0L0 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
VAPAQ9P0L0 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
VAPAQ9P0L0 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
VAPAQ9P0L0 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VAPAQ9P0L0 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VAPAQ9P0L0 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
VAPAQ9P0L0 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VAPAQ9P0L0 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
VAPAQ9P0L0 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VAPAQ9P0L0 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VAPAQ9P0L0 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
VAPAQ9P0L0 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
VAPAQ9P0L0 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
VAPAQ9P0L0 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VAPAQ9P0L0 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VAPAQ9P0L0 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VAPAQ9P0L0 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VAPAQ9P0L0 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VAPAQ9P0L0 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VAPAQ9P0L0 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VAPAQ9P0L0 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VAPAQ9P0L0 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
VAPAQ9P0L0 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VAPAQ9P0L0 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VAPAQ9P0L0 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
VAPAQ9P0L0 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
VAPAQ9P0L0 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
VAPAQ9P0L0 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
VAPAQ9P0L0 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
VAPAQ9P0L0 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VAPAQ9P0L0 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC15.07■□□□□ 0
VAPAQ9P0L0 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC15.07■□□□□ 0
VAPAQ9P0L0 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
VAPAQ9P0L0 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
VAPAQ9P0L0 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VAPAQ9P0L0 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VAPAQ9P0L0 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VAPAQ9P0L0 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VAPAQ9P0L0 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VAPAQ9P0L0 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VAPAQ9P0L0 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VAPAQ9P0L0 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
VAPAQ9P0L0 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VAPAQ9P0L0 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
VAPAQ9P0L0 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
VAPAQ9P0L0 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.07■□□□□ 0
VAPAQ9P0L0 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VAPAQ9P0L0 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VAPAQ9P0L0 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
VAPAQ9P0L0 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VAPAQ9P0L0 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
VAPAQ9P0L0 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VAPAQ9P0L0 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
VAPAQ9P0L0 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VAPAQ9P0L0 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC15.06■□□□□ 0
VAPAQ9P0L0 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VAPAQ9P0L0 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VAPAQ9P0L0 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
VAPAQ9P0L0 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VAPAQ9P0L0 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
VAPAQ9P0L0 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
VAPAQ9P0L0 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.06■□□□□ 0
VAPAQ9P0L0 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VAPAQ9P0L0 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
VAPAQ9P0L0 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
VAPAQ9P0L0 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
VAPAQ9P0L0 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
VAPAQ9P0L0 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
VAPAQ9P0L0 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
VAPAQ9P0L0 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
VAPAQ9P0L0 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
VAPAQ9P0L0 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
VAPAQ9P0L0 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC15.06■□□□□ 0
VAPAQ9P0L0 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
VAPAQ9P0L0 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
VAPAQ9P0L0 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC15.06■□□□□ 0
VAPAQ9P0L0 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC15.06■□□□□ 0
VAPAQ9P0L0 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC15.06■□□□□ 0
VAPAQ9P0L0 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms