Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J7

KCMF1, E3 ubiquitin-protein ligase KCMF1, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCMF1Q9P0J7 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KCMF1Q9P0J7 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KCMF1Q9P0J7 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KCMF1Q9P0J7 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KCMF1Q9P0J7 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KCMF1Q9P0J7 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
KCMF1Q9P0J7 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KCMF1Q9P0J7 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KCMF1Q9P0J7 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KCMF1Q9P0J7 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KCMF1Q9P0J7 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KCMF1Q9P0J7 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KCMF1Q9P0J7 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
KCMF1Q9P0J7 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KCMF1Q9P0J7 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KCMF1Q9P0J7 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KCMF1Q9P0J7 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KCMF1Q9P0J7 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KCMF1Q9P0J7 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KCMF1Q9P0J7 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KCMF1Q9P0J7 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KCMF1Q9P0J7 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KCMF1Q9P0J7 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KCMF1Q9P0J7 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KCMF1Q9P0J7 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KCMF1Q9P0J7 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KCMF1Q9P0J7 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KCMF1Q9P0J7 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KCMF1Q9P0J7 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KCMF1Q9P0J7 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KCMF1Q9P0J7 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KCMF1Q9P0J7 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KCMF1Q9P0J7 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KCMF1Q9P0J7 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KCMF1Q9P0J7 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KCMF1Q9P0J7 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KCMF1Q9P0J7 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KCMF1Q9P0J7 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KCMF1Q9P0J7 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KCMF1Q9P0J7 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
KCMF1Q9P0J7 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
KCMF1Q9P0J7 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KCMF1Q9P0J7 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KCMF1Q9P0J7 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KCMF1Q9P0J7 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KCMF1Q9P0J7 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KCMF1Q9P0J7 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
KCMF1Q9P0J7 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KCMF1Q9P0J7 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KCMF1Q9P0J7 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KCMF1Q9P0J7 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KCMF1Q9P0J7 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KCMF1Q9P0J7 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KCMF1Q9P0J7 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KCMF1Q9P0J7 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KCMF1Q9P0J7 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KCMF1Q9P0J7 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KCMF1Q9P0J7 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
KCMF1Q9P0J7 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KCMF1Q9P0J7 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KCMF1Q9P0J7 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCMF1Q9P0J7 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCMF1Q9P0J7 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCMF1Q9P0J7 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCMF1Q9P0J7 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCMF1Q9P0J7 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCMF1Q9P0J7 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCMF1Q9P0J7 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCMF1Q9P0J7 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCMF1Q9P0J7 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCMF1Q9P0J7 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCMF1Q9P0J7 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCMF1Q9P0J7 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCMF1Q9P0J7 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCMF1Q9P0J7 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCMF1Q9P0J7 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCMF1Q9P0J7 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCMF1Q9P0J7 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCMF1Q9P0J7 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCMF1Q9P0J7 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCMF1Q9P0J7 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCMF1Q9P0J7 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCMF1Q9P0J7 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCMF1Q9P0J7 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCMF1Q9P0J7 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
KCMF1Q9P0J7 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
KCMF1Q9P0J7 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCMF1Q9P0J7 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCMF1Q9P0J7 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
KCMF1Q9P0J7 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCMF1Q9P0J7 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCMF1Q9P0J7 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCMF1Q9P0J7 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCMF1Q9P0J7 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
KCMF1Q9P0J7 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCMF1Q9P0J7 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCMF1Q9P0J7 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCMF1Q9P0J7 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCMF1Q9P0J7 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCMF1Q9P0J7 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.7 ms