Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZR2

LRP1B, Low-density lipoprotein receptor-related protein 1B, humanhuman

Predictions only

Length 4,599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1BQ9NZR2 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
LRP1BQ9NZR2 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
LRP1BQ9NZR2 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
LRP1BQ9NZR2 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
LRP1BQ9NZR2 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
LRP1BQ9NZR2 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
LRP1BQ9NZR2 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
LRP1BQ9NZR2 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
LRP1BQ9NZR2 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
LRP1BQ9NZR2 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
LRP1BQ9NZR2 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
LRP1BQ9NZR2 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
LRP1BQ9NZR2 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
LRP1BQ9NZR2 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
LRP1BQ9NZR2 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
LRP1BQ9NZR2 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
LRP1BQ9NZR2 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
LRP1BQ9NZR2 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
LRP1BQ9NZR2 CSTF3-206ENST00000524827 693 ntTSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
LRP1BQ9NZR2 PLIN5-202ENST00000586133 907 ntTSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
LRP1BQ9NZR2 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
LRP1BQ9NZR2 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
LRP1BQ9NZR2 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
LRP1BQ9NZR2 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
LRP1BQ9NZR2 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
LRP1BQ9NZR2 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
LRP1BQ9NZR2 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
LRP1BQ9NZR2 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
LRP1BQ9NZR2 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
LRP1BQ9NZR2 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
LRP1BQ9NZR2 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
LRP1BQ9NZR2 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
LRP1BQ9NZR2 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
LRP1BQ9NZR2 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
LRP1BQ9NZR2 NR0B2-201ENST00000254227 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
LRP1BQ9NZR2 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
LRP1BQ9NZR2 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
LRP1BQ9NZR2 RPL37A-203ENST00000427280 698 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
LRP1BQ9NZR2 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
LRP1BQ9NZR2 RPL37A-206ENST00000456586 401 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
LRP1BQ9NZR2 AC137723.1-201ENST00000584705 709 ntTSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
LRP1BQ9NZR2 RPL37A-211ENST00000598925 775 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
LRP1BQ9NZR2 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
LRP1BQ9NZR2 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
LRP1BQ9NZR2 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
LRP1BQ9NZR2 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
LRP1BQ9NZR2 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
LRP1BQ9NZR2 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
LRP1BQ9NZR2 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
LRP1BQ9NZR2 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
LRP1BQ9NZR2 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
LRP1BQ9NZR2 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
LRP1BQ9NZR2 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
LRP1BQ9NZR2 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
LRP1BQ9NZR2 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
LRP1BQ9NZR2 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
LRP1BQ9NZR2 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
LRP1BQ9NZR2 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
LRP1BQ9NZR2 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
LRP1BQ9NZR2 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
LRP1BQ9NZR2 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
LRP1BQ9NZR2 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
LRP1BQ9NZR2 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
LRP1BQ9NZR2 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
LRP1BQ9NZR2 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
LRP1BQ9NZR2 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
LRP1BQ9NZR2 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
LRP1BQ9NZR2 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
LRP1BQ9NZR2 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
LRP1BQ9NZR2 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
LRP1BQ9NZR2 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
LRP1BQ9NZR2 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
LRP1BQ9NZR2 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
LRP1BQ9NZR2 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
LRP1BQ9NZR2 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
LRP1BQ9NZR2 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
LRP1BQ9NZR2 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
LRP1BQ9NZR2 KDSR-201ENST00000326575 1024 ntTSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
LRP1BQ9NZR2 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
LRP1BQ9NZR2 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
LRP1BQ9NZR2 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
LRP1BQ9NZR2 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC9.87□□□□□ -0.83
LRP1BQ9NZR2 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
LRP1BQ9NZR2 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
LRP1BQ9NZR2 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
LRP1BQ9NZR2 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
LRP1BQ9NZR2 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
LRP1BQ9NZR2 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
LRP1BQ9NZR2 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
LRP1BQ9NZR2 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
LRP1BQ9NZR2 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
LRP1BQ9NZR2 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
LRP1BQ9NZR2 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
LRP1BQ9NZR2 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
LRP1BQ9NZR2 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
LRP1BQ9NZR2 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC9.87□□□□□ -0.83
LRP1BQ9NZR2 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
LRP1BQ9NZR2 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
LRP1BQ9NZR2 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
LRP1BQ9NZR2 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms