Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXP7

GIN1, Gypsy retrotransposon integrase-like protein 1, humanhuman

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Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIN1Q9NXP7 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GIN1Q9NXP7 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GIN1Q9NXP7 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GIN1Q9NXP7 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GIN1Q9NXP7 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GIN1Q9NXP7 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GIN1Q9NXP7 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GIN1Q9NXP7 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GIN1Q9NXP7 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GIN1Q9NXP7 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GIN1Q9NXP7 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GIN1Q9NXP7 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
GIN1Q9NXP7 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GIN1Q9NXP7 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GIN1Q9NXP7 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GIN1Q9NXP7 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GIN1Q9NXP7 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GIN1Q9NXP7 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
GIN1Q9NXP7 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GIN1Q9NXP7 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
GIN1Q9NXP7 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GIN1Q9NXP7 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
GIN1Q9NXP7 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
GIN1Q9NXP7 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GIN1Q9NXP7 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GIN1Q9NXP7 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
GIN1Q9NXP7 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GIN1Q9NXP7 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
GIN1Q9NXP7 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GIN1Q9NXP7 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GIN1Q9NXP7 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GIN1Q9NXP7 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GIN1Q9NXP7 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
GIN1Q9NXP7 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GIN1Q9NXP7 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GIN1Q9NXP7 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GIN1Q9NXP7 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GIN1Q9NXP7 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
GIN1Q9NXP7 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GIN1Q9NXP7 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GIN1Q9NXP7 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GIN1Q9NXP7 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GIN1Q9NXP7 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GIN1Q9NXP7 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GIN1Q9NXP7 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
GIN1Q9NXP7 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GIN1Q9NXP7 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GIN1Q9NXP7 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GIN1Q9NXP7 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GIN1Q9NXP7 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GIN1Q9NXP7 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GIN1Q9NXP7 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GIN1Q9NXP7 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GIN1Q9NXP7 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GIN1Q9NXP7 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GIN1Q9NXP7 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GIN1Q9NXP7 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GIN1Q9NXP7 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GIN1Q9NXP7 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GIN1Q9NXP7 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GIN1Q9NXP7 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GIN1Q9NXP7 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GIN1Q9NXP7 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GIN1Q9NXP7 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GIN1Q9NXP7 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GIN1Q9NXP7 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GIN1Q9NXP7 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GIN1Q9NXP7 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GIN1Q9NXP7 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GIN1Q9NXP7 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GIN1Q9NXP7 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GIN1Q9NXP7 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GIN1Q9NXP7 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GIN1Q9NXP7 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GIN1Q9NXP7 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GIN1Q9NXP7 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GIN1Q9NXP7 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GIN1Q9NXP7 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GIN1Q9NXP7 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GIN1Q9NXP7 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GIN1Q9NXP7 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GIN1Q9NXP7 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GIN1Q9NXP7 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GIN1Q9NXP7 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GIN1Q9NXP7 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GIN1Q9NXP7 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GIN1Q9NXP7 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GIN1Q9NXP7 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GIN1Q9NXP7 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GIN1Q9NXP7 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GIN1Q9NXP7 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GIN1Q9NXP7 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GIN1Q9NXP7 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GIN1Q9NXP7 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GIN1Q9NXP7 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
GIN1Q9NXP7 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GIN1Q9NXP7 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GIN1Q9NXP7 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GIN1Q9NXP7 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GIN1Q9NXP7 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
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