Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQP4

PFDN4, Prefoldin subunit 4, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFDN4Q9NQP4 PAPPA-201ENST00000328252 10959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PFDN4Q9NQP4 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PFDN4Q9NQP4 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PFDN4Q9NQP4 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PFDN4Q9NQP4 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PFDN4Q9NQP4 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PFDN4Q9NQP4 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PFDN4Q9NQP4 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PFDN4Q9NQP4 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PFDN4Q9NQP4 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PFDN4Q9NQP4 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PFDN4Q9NQP4 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PFDN4Q9NQP4 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PFDN4Q9NQP4 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PFDN4Q9NQP4 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PFDN4Q9NQP4 PLXNB2-207ENST00000449103 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PFDN4Q9NQP4 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PFDN4Q9NQP4 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PFDN4Q9NQP4 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PFDN4Q9NQP4 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PFDN4Q9NQP4 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PFDN4Q9NQP4 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PFDN4Q9NQP4 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PFDN4Q9NQP4 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PFDN4Q9NQP4 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PFDN4Q9NQP4 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PFDN4Q9NQP4 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PFDN4Q9NQP4 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PFDN4Q9NQP4 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PFDN4Q9NQP4 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PFDN4Q9NQP4 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PFDN4Q9NQP4 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PFDN4Q9NQP4 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PFDN4Q9NQP4 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PFDN4Q9NQP4 KIRREL1-204ENST00000368173 7519 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PFDN4Q9NQP4 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PFDN4Q9NQP4 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PFDN4Q9NQP4 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PFDN4Q9NQP4 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PFDN4Q9NQP4 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PFDN4Q9NQP4 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PFDN4Q9NQP4 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PFDN4Q9NQP4 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PFDN4Q9NQP4 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PFDN4Q9NQP4 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PFDN4Q9NQP4 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PFDN4Q9NQP4 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PFDN4Q9NQP4 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PFDN4Q9NQP4 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PFDN4Q9NQP4 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PFDN4Q9NQP4 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PFDN4Q9NQP4 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PFDN4Q9NQP4 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PFDN4Q9NQP4 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PFDN4Q9NQP4 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PFDN4Q9NQP4 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PFDN4Q9NQP4 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PFDN4Q9NQP4 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PFDN4Q9NQP4 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PFDN4Q9NQP4 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PFDN4Q9NQP4 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PFDN4Q9NQP4 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PFDN4Q9NQP4 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PFDN4Q9NQP4 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PFDN4Q9NQP4 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PFDN4Q9NQP4 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PFDN4Q9NQP4 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PFDN4Q9NQP4 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PFDN4Q9NQP4 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PFDN4Q9NQP4 COL22A1-201ENST00000303045 6346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PFDN4Q9NQP4 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PFDN4Q9NQP4 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PFDN4Q9NQP4 NRXN1-222ENST00000625672 8113 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PFDN4Q9NQP4 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PFDN4Q9NQP4 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PFDN4Q9NQP4 SLC12A5-211ENST00000616933 6166 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PFDN4Q9NQP4 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PFDN4Q9NQP4 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PFDN4Q9NQP4 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PFDN4Q9NQP4 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PFDN4Q9NQP4 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PFDN4Q9NQP4 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PFDN4Q9NQP4 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PFDN4Q9NQP4 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PFDN4Q9NQP4 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PFDN4Q9NQP4 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PFDN4Q9NQP4 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PFDN4Q9NQP4 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PFDN4Q9NQP4 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PFDN4Q9NQP4 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PFDN4Q9NQP4 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PFDN4Q9NQP4 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PFDN4Q9NQP4 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PFDN4Q9NQP4 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PFDN4Q9NQP4 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PFDN4Q9NQP4 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PFDN4Q9NQP4 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PFDN4Q9NQP4 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PFDN4Q9NQP4 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PFDN4Q9NQP4 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
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