Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI8

FANCF, Fanconi anemia group F protein, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCFQ9NPI8 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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FANCFQ9NPI8 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
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FANCFQ9NPI8 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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FANCFQ9NPI8 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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FANCFQ9NPI8 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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