Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPD5

SLCO1B3, Solute carrier organic anion transporter family member 1B3, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLCO1B3Q9NPD5 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLCO1B3Q9NPD5 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLCO1B3Q9NPD5 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLCO1B3Q9NPD5 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLCO1B3Q9NPD5 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SLCO1B3Q9NPD5 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLCO1B3Q9NPD5 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLCO1B3Q9NPD5 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLCO1B3Q9NPD5 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLCO1B3Q9NPD5 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLCO1B3Q9NPD5 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLCO1B3Q9NPD5 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLCO1B3Q9NPD5 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLCO1B3Q9NPD5 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLCO1B3Q9NPD5 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLCO1B3Q9NPD5 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLCO1B3Q9NPD5 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLCO1B3Q9NPD5 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLCO1B3Q9NPD5 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLCO1B3Q9NPD5 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLCO1B3Q9NPD5 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLCO1B3Q9NPD5 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLCO1B3Q9NPD5 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLCO1B3Q9NPD5 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLCO1B3Q9NPD5 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLCO1B3Q9NPD5 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SLCO1B3Q9NPD5 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLCO1B3Q9NPD5 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLCO1B3Q9NPD5 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLCO1B3Q9NPD5 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLCO1B3Q9NPD5 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLCO1B3Q9NPD5 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLCO1B3Q9NPD5 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLCO1B3Q9NPD5 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLCO1B3Q9NPD5 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SLCO1B3Q9NPD5 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SLCO1B3Q9NPD5 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLCO1B3Q9NPD5 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SLCO1B3Q9NPD5 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLCO1B3Q9NPD5 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLCO1B3Q9NPD5 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLCO1B3Q9NPD5 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLCO1B3Q9NPD5 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLCO1B3Q9NPD5 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLCO1B3Q9NPD5 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLCO1B3Q9NPD5 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLCO1B3Q9NPD5 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLCO1B3Q9NPD5 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLCO1B3Q9NPD5 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLCO1B3Q9NPD5 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLCO1B3Q9NPD5 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLCO1B3Q9NPD5 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLCO1B3Q9NPD5 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLCO1B3Q9NPD5 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLCO1B3Q9NPD5 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLCO1B3Q9NPD5 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLCO1B3Q9NPD5 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLCO1B3Q9NPD5 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLCO1B3Q9NPD5 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLCO1B3Q9NPD5 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLCO1B3Q9NPD5 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLCO1B3Q9NPD5 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLCO1B3Q9NPD5 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLCO1B3Q9NPD5 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLCO1B3Q9NPD5 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLCO1B3Q9NPD5 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLCO1B3Q9NPD5 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLCO1B3Q9NPD5 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLCO1B3Q9NPD5 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLCO1B3Q9NPD5 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLCO1B3Q9NPD5 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLCO1B3Q9NPD5 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLCO1B3Q9NPD5 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLCO1B3Q9NPD5 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLCO1B3Q9NPD5 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLCO1B3Q9NPD5 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLCO1B3Q9NPD5 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLCO1B3Q9NPD5 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLCO1B3Q9NPD5 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLCO1B3Q9NPD5 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLCO1B3Q9NPD5 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLCO1B3Q9NPD5 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLCO1B3Q9NPD5 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SLCO1B3Q9NPD5 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SLCO1B3Q9NPD5 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLCO1B3Q9NPD5 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLCO1B3Q9NPD5 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SLCO1B3Q9NPD5 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SLCO1B3Q9NPD5 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLCO1B3Q9NPD5 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLCO1B3Q9NPD5 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLCO1B3Q9NPD5 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLCO1B3Q9NPD5 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLCO1B3Q9NPD5 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLCO1B3Q9NPD5 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLCO1B3Q9NPD5 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
SLCO1B3Q9NPD5 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLCO1B3Q9NPD5 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLCO1B3Q9NPD5 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLCO1B3Q9NPD5 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms