Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL3

SMIM3, Small integral membrane protein 3, humanhuman

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Length 60 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM3Q9BZL3 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 DPYSL2-204ENST00000521913 4805 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 GRM1-203ENST00000361719 6754 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 GNB1L-201ENST00000329517 6706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 RBFADN-204ENST00000568911 5187 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 AGRN-210ENST00000620552 7394 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 ABCA2-203ENST00000371605 8151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 AL356275.1-201ENST00000638446 7440 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 EPHB3-201ENST00000330394 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 SNPH-201ENST00000381867 5533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 MROH2A-201ENST00000389758 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
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