Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG8

GSDMC, Gasdermin-C, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSDMCQ9BYG8 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GSDMCQ9BYG8 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GSDMCQ9BYG8 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GSDMCQ9BYG8 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GSDMCQ9BYG8 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GSDMCQ9BYG8 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GSDMCQ9BYG8 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GSDMCQ9BYG8 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GSDMCQ9BYG8 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GSDMCQ9BYG8 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GSDMCQ9BYG8 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GSDMCQ9BYG8 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GSDMCQ9BYG8 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GSDMCQ9BYG8 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GSDMCQ9BYG8 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GSDMCQ9BYG8 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GSDMCQ9BYG8 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GSDMCQ9BYG8 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GSDMCQ9BYG8 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GSDMCQ9BYG8 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GSDMCQ9BYG8 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GSDMCQ9BYG8 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GSDMCQ9BYG8 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GSDMCQ9BYG8 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GSDMCQ9BYG8 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GSDMCQ9BYG8 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GSDMCQ9BYG8 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GSDMCQ9BYG8 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GSDMCQ9BYG8 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GSDMCQ9BYG8 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GSDMCQ9BYG8 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GSDMCQ9BYG8 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GSDMCQ9BYG8 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GSDMCQ9BYG8 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GSDMCQ9BYG8 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GSDMCQ9BYG8 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GSDMCQ9BYG8 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GSDMCQ9BYG8 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GSDMCQ9BYG8 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GSDMCQ9BYG8 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GSDMCQ9BYG8 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GSDMCQ9BYG8 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GSDMCQ9BYG8 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GSDMCQ9BYG8 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GSDMCQ9BYG8 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GSDMCQ9BYG8 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GSDMCQ9BYG8 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GSDMCQ9BYG8 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GSDMCQ9BYG8 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GSDMCQ9BYG8 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GSDMCQ9BYG8 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GSDMCQ9BYG8 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GSDMCQ9BYG8 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GSDMCQ9BYG8 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GSDMCQ9BYG8 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GSDMCQ9BYG8 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GSDMCQ9BYG8 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GSDMCQ9BYG8 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GSDMCQ9BYG8 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
GSDMCQ9BYG8 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GSDMCQ9BYG8 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
GSDMCQ9BYG8 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
GSDMCQ9BYG8 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GSDMCQ9BYG8 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
GSDMCQ9BYG8 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GSDMCQ9BYG8 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
GSDMCQ9BYG8 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
GSDMCQ9BYG8 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
GSDMCQ9BYG8 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
GSDMCQ9BYG8 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
GSDMCQ9BYG8 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GSDMCQ9BYG8 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GSDMCQ9BYG8 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GSDMCQ9BYG8 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GSDMCQ9BYG8 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GSDMCQ9BYG8 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GSDMCQ9BYG8 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GSDMCQ9BYG8 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GSDMCQ9BYG8 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GSDMCQ9BYG8 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GSDMCQ9BYG8 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GSDMCQ9BYG8 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GSDMCQ9BYG8 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GSDMCQ9BYG8 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GSDMCQ9BYG8 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GSDMCQ9BYG8 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GSDMCQ9BYG8 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GSDMCQ9BYG8 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GSDMCQ9BYG8 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GSDMCQ9BYG8 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GSDMCQ9BYG8 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GSDMCQ9BYG8 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GSDMCQ9BYG8 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GSDMCQ9BYG8 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GSDMCQ9BYG8 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GSDMCQ9BYG8 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GSDMCQ9BYG8 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GSDMCQ9BYG8 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GSDMCQ9BYG8 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GSDMCQ9BYG8 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms