Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXF6

RAB11FIP5, Rab11 family-interacting protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP5Q9BXF6 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB11FIP5Q9BXF6 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB11FIP5Q9BXF6 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB11FIP5Q9BXF6 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB11FIP5Q9BXF6 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB11FIP5Q9BXF6 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB11FIP5Q9BXF6 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB11FIP5Q9BXF6 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB11FIP5Q9BXF6 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB11FIP5Q9BXF6 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB11FIP5Q9BXF6 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB11FIP5Q9BXF6 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB11FIP5Q9BXF6 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB11FIP5Q9BXF6 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB11FIP5Q9BXF6 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB11FIP5Q9BXF6 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB11FIP5Q9BXF6 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB11FIP5Q9BXF6 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB11FIP5Q9BXF6 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB11FIP5Q9BXF6 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB11FIP5Q9BXF6 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB11FIP5Q9BXF6 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB11FIP5Q9BXF6 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB11FIP5Q9BXF6 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB11FIP5Q9BXF6 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB11FIP5Q9BXF6 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB11FIP5Q9BXF6 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB11FIP5Q9BXF6 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB11FIP5Q9BXF6 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB11FIP5Q9BXF6 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB11FIP5Q9BXF6 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB11FIP5Q9BXF6 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB11FIP5Q9BXF6 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB11FIP5Q9BXF6 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB11FIP5Q9BXF6 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB11FIP5Q9BXF6 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB11FIP5Q9BXF6 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB11FIP5Q9BXF6 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB11FIP5Q9BXF6 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB11FIP5Q9BXF6 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB11FIP5Q9BXF6 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB11FIP5Q9BXF6 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB11FIP5Q9BXF6 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB11FIP5Q9BXF6 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB11FIP5Q9BXF6 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB11FIP5Q9BXF6 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB11FIP5Q9BXF6 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB11FIP5Q9BXF6 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB11FIP5Q9BXF6 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB11FIP5Q9BXF6 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB11FIP5Q9BXF6 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB11FIP5Q9BXF6 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB11FIP5Q9BXF6 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB11FIP5Q9BXF6 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB11FIP5Q9BXF6 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB11FIP5Q9BXF6 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB11FIP5Q9BXF6 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB11FIP5Q9BXF6 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RAB11FIP5Q9BXF6 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RAB11FIP5Q9BXF6 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RAB11FIP5Q9BXF6 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RAB11FIP5Q9BXF6 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RAB11FIP5Q9BXF6 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RAB11FIP5Q9BXF6 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RAB11FIP5Q9BXF6 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RAB11FIP5Q9BXF6 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RAB11FIP5Q9BXF6 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RAB11FIP5Q9BXF6 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RAB11FIP5Q9BXF6 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms