Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA0

KATNB1, Katanin p80 WD40 repeat-containing subunit B1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KATNB1Q9BVA0 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KATNB1Q9BVA0 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KATNB1Q9BVA0 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KATNB1Q9BVA0 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KATNB1Q9BVA0 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
KATNB1Q9BVA0 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
KATNB1Q9BVA0 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KATNB1Q9BVA0 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KATNB1Q9BVA0 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KATNB1Q9BVA0 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KATNB1Q9BVA0 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KATNB1Q9BVA0 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KATNB1Q9BVA0 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
KATNB1Q9BVA0 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KATNB1Q9BVA0 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KATNB1Q9BVA0 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KATNB1Q9BVA0 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KATNB1Q9BVA0 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KATNB1Q9BVA0 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KATNB1Q9BVA0 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KATNB1Q9BVA0 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KATNB1Q9BVA0 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KATNB1Q9BVA0 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
KATNB1Q9BVA0 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
KATNB1Q9BVA0 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
KATNB1Q9BVA0 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
KATNB1Q9BVA0 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
KATNB1Q9BVA0 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
KATNB1Q9BVA0 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
KATNB1Q9BVA0 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
KATNB1Q9BVA0 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
KATNB1Q9BVA0 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
KATNB1Q9BVA0 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
KATNB1Q9BVA0 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
KATNB1Q9BVA0 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
KATNB1Q9BVA0 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
KATNB1Q9BVA0 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
KATNB1Q9BVA0 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
KATNB1Q9BVA0 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
KATNB1Q9BVA0 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
KATNB1Q9BVA0 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
KATNB1Q9BVA0 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
KATNB1Q9BVA0 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
KATNB1Q9BVA0 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
KATNB1Q9BVA0 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
KATNB1Q9BVA0 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
KATNB1Q9BVA0 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
KATNB1Q9BVA0 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
KATNB1Q9BVA0 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
KATNB1Q9BVA0 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
KATNB1Q9BVA0 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
KATNB1Q9BVA0 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
KATNB1Q9BVA0 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
KATNB1Q9BVA0 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
KATNB1Q9BVA0 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
KATNB1Q9BVA0 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
KATNB1Q9BVA0 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
KATNB1Q9BVA0 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
KATNB1Q9BVA0 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
KATNB1Q9BVA0 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
KATNB1Q9BVA0 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
KATNB1Q9BVA0 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
KATNB1Q9BVA0 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
KATNB1Q9BVA0 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
KATNB1Q9BVA0 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
KATNB1Q9BVA0 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
KATNB1Q9BVA0 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
KATNB1Q9BVA0 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
KATNB1Q9BVA0 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
KATNB1Q9BVA0 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
KATNB1Q9BVA0 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
KATNB1Q9BVA0 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
KATNB1Q9BVA0 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
KATNB1Q9BVA0 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
KATNB1Q9BVA0 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
KATNB1Q9BVA0 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
KATNB1Q9BVA0 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
KATNB1Q9BVA0 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
KATNB1Q9BVA0 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
KATNB1Q9BVA0 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
KATNB1Q9BVA0 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
KATNB1Q9BVA0 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
KATNB1Q9BVA0 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
KATNB1Q9BVA0 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
KATNB1Q9BVA0 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
KATNB1Q9BVA0 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
KATNB1Q9BVA0 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
KATNB1Q9BVA0 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
KATNB1Q9BVA0 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
KATNB1Q9BVA0 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
KATNB1Q9BVA0 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
KATNB1Q9BVA0 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
KATNB1Q9BVA0 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
KATNB1Q9BVA0 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
KATNB1Q9BVA0 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
KATNB1Q9BVA0 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
KATNB1Q9BVA0 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
KATNB1Q9BVA0 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
KATNB1Q9BVA0 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
KATNB1Q9BVA0 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms