Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV19

C1orf50, Uncharacterized protein C1orf50, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf50Q9BV19 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
C1orf50Q9BV19 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
C1orf50Q9BV19 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1orf50Q9BV19 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1orf50Q9BV19 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1orf50Q9BV19 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1orf50Q9BV19 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1orf50Q9BV19 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1orf50Q9BV19 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1orf50Q9BV19 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
C1orf50Q9BV19 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
C1orf50Q9BV19 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1orf50Q9BV19 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
C1orf50Q9BV19 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1orf50Q9BV19 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1orf50Q9BV19 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1orf50Q9BV19 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1orf50Q9BV19 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1orf50Q9BV19 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
C1orf50Q9BV19 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1orf50Q9BV19 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1orf50Q9BV19 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1orf50Q9BV19 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C1orf50Q9BV19 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C1orf50Q9BV19 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
C1orf50Q9BV19 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
C1orf50Q9BV19 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C1orf50Q9BV19 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
C1orf50Q9BV19 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C1orf50Q9BV19 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C1orf50Q9BV19 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C1orf50Q9BV19 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C1orf50Q9BV19 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C1orf50Q9BV19 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C1orf50Q9BV19 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C1orf50Q9BV19 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C1orf50Q9BV19 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C1orf50Q9BV19 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C1orf50Q9BV19 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
C1orf50Q9BV19 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C1orf50Q9BV19 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C1orf50Q9BV19 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C1orf50Q9BV19 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C1orf50Q9BV19 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C1orf50Q9BV19 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C1orf50Q9BV19 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C1orf50Q9BV19 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C1orf50Q9BV19 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C1orf50Q9BV19 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C1orf50Q9BV19 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C1orf50Q9BV19 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C1orf50Q9BV19 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C1orf50Q9BV19 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C1orf50Q9BV19 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C1orf50Q9BV19 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C1orf50Q9BV19 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C1orf50Q9BV19 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C1orf50Q9BV19 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C1orf50Q9BV19 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C1orf50Q9BV19 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C1orf50Q9BV19 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C1orf50Q9BV19 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
C1orf50Q9BV19 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C1orf50Q9BV19 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C1orf50Q9BV19 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C1orf50Q9BV19 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C1orf50Q9BV19 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1orf50Q9BV19 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1orf50Q9BV19 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1orf50Q9BV19 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1orf50Q9BV19 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1orf50Q9BV19 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1orf50Q9BV19 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1orf50Q9BV19 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1orf50Q9BV19 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1orf50Q9BV19 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1orf50Q9BV19 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1orf50Q9BV19 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1orf50Q9BV19 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1orf50Q9BV19 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1orf50Q9BV19 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1orf50Q9BV19 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1orf50Q9BV19 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1orf50Q9BV19 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1orf50Q9BV19 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1orf50Q9BV19 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1orf50Q9BV19 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1orf50Q9BV19 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1orf50Q9BV19 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1orf50Q9BV19 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1orf50Q9BV19 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1orf50Q9BV19 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
C1orf50Q9BV19 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1orf50Q9BV19 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1orf50Q9BV19 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1orf50Q9BV19 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
C1orf50Q9BV19 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1orf50Q9BV19 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1orf50Q9BV19 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1orf50Q9BV19 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms